微機(jī)集群組建、優(yōu)化和管理

第1章超級(jí)計(jì)算機(jī)的發(fā)展方向
1.1市場(chǎng)是決定性的因素
1.2微機(jī)集群的歷史
1.3微機(jī)集群的現(xiàn)狀
1.4微機(jī)集群的技術(shù)
1.5微機(jī)集群的可靠性
1.6微機(jī)集群的優(yōu)勢(shì)
1.7微機(jī)集群的局限
1.8微機(jī)集群的趨勢(shì)
第2章并行計(jì)算概念及其所需的網(wǎng)絡(luò)服務(wù),
2.1并行計(jì)算的基本概念
2.1.1一維數(shù)值積分例子
2.1.2串行計(jì)算程序
2.1.3并行計(jì)算的基本概念
2.2消息傳遞界面并行計(jì)算
2.2.1消息傳遞模式的并行計(jì)算
2.2.2MPI并行計(jì)算的初始化
2.2.3MPI并行計(jì)算編程
2.3TCP／IP通信協(xié)議
2.3.1TCP／IP通信協(xié)議
2.3.2IP地址
2.3.3子網(wǎng)掩碼(netmask)
2.3.4路由(router)
2.3.5域名(domain)
2.4微機(jī)集群所需的網(wǎng)絡(luò)功能
2.4.1微機(jī)集群的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)
2.4.2網(wǎng)絡(luò)信息服務(wù)(NIS)
2.4.3網(wǎng)絡(luò)文件系統(tǒng)(NFS)
2.4.4遠(yuǎn)程Shell命令(rsh)
2.5微機(jī)集群的網(wǎng)絡(luò)設(shè)計(jì)
2.5.1域名
2.5.2IP地址
2.5.3所需安裝的軟件
第3章微機(jī)集群的Linux安裝和配置
3.1Linux系統(tǒng)安裝
3.1.1進(jìn)入安裝
3.1.2硬盤分區(qū)
3.1.3選擇軟件
3.1.4啟動(dòng)預(yù)設(shè)置
3.1.5安裝過
3.2YaST管理工具
3.2.1什么是YaST
3.2.2YaST管理功能
3.3微機(jī)集群服務(wù)器的網(wǎng)絡(luò)功能設(shè)置
3.3.1基本網(wǎng)絡(luò)設(shè)置
3.3.2NFS設(shè)置
3.3.3NIS設(shè)置
3.3.4啟動(dòng)網(wǎng)絡(luò)服務(wù)
3.4微機(jī)集群節(jié)點(diǎn)機(jī)的網(wǎng)絡(luò)功能設(shè)置
3.4.1基本網(wǎng)絡(luò)設(shè)置
3.4.2NFS設(shè)置
3.4.3NIS設(shè)置
3.4.4啟動(dòng)網(wǎng)絡(luò)服務(wù)
3.5內(nèi)核的重新編譯
3.5.1了解內(nèi)核
3.5.2內(nèi)核編譯步驟
3.5.3LILO引導(dǎo)啟動(dòng)設(shè)置
3.5.4內(nèi)核選項(xiàng)簡(jiǎn)介
3.6并行環(huán)境lammpi的安裝
3.6.1lammpi軟件及其獲取
3.6.2lammpi軟件安裝步驟
3.6.3lammpi軟件的簡(jiǎn)單測(cè)試
第4章微機(jī)集群的性能測(cè)試
4.1微機(jī)集群的連接
4.1.1網(wǎng)絡(luò)的連接材料
4.1.2網(wǎng)線的接口標(biāo)準(zhǔn)
4.1.3網(wǎng)線的制作過程
4.1.4兩臺(tái)微機(jī)的直接連接
4.2集群所需網(wǎng)絡(luò)功能的檢測(cè)
4.2.1網(wǎng)絡(luò)基本性能
4.2.2NIS
4.2.3NFS
4.2.4rsh
4.3啟動(dòng)lammpi并行平臺(tái)常遇問題
4.3.1基本的網(wǎng)絡(luò)問題
4.3.2節(jié)點(diǎn)機(jī)中l(wèi)am的路徑問題
4.3.3節(jié)點(diǎn)機(jī)中/tmp目錄問題
4.4一維數(shù)值積分并行程序測(cè)試
4.4.1并行計(jì)算程序及編譯
4.4.2執(zhí)行l(wèi)ammpi并行計(jì)算的步驟
4.4.3串行計(jì)算程序
4.4.4串.并行計(jì)算速度比較
4.4.5并行計(jì)算中的負(fù)載平衡問題
4.5lamtests測(cè)試
4.5.1lamtests的測(cè)試內(nèi)容和獲取
4.5.2lamtests的編譯和測(cè)試
4.6Linpack速度測(cè)試
4.6.1什么是Linpack速度測(cè)試
4.6.2Linpack測(cè)試程序包的獲取和編譯
4.6.3Linpack測(cè)試速度
4.6.4Linpack測(cè)試的可調(diào)參數(shù)
第5章微機(jī)集群的性能優(yōu)化
5.1節(jié)點(diǎn)機(jī)的網(wǎng)絡(luò)喚醒和停機(jī)
5.1.1網(wǎng)絡(luò)喚醒的BIOS設(shè)置
5.1.2網(wǎng)絡(luò)喚醒的驅(qū)動(dòng)
5.1.3節(jié)點(diǎn)機(jī)的網(wǎng)絡(luò)喚醒
5.1.4讓指定的普通用戶執(zhí)行部分管理功能
5.1.5節(jié)點(diǎn)機(jī)的停機(jī)和重啟
5.2用dhcp服務(wù)器進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)配置
5.2.1dhcp協(xié)議及服務(wù)功能
5.2.2dhcp服務(wù)器的安裝
5.2.3dhcp服務(wù)器的配置和啟動(dòng)
5.2.4dhcp客戶機(jī)的配置
5.2.5dhcp服務(wù)器的配置文件
5.3如何復(fù)制節(jié)點(diǎn)機(jī)
5.3.1ghost軟件
5.3.2硬盤對(duì)硬盤復(fù)制
5.4網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)
5.4.1為何需要網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)
5.4.2網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)過程
5.4.3網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)的硬件要求
5.4.4網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)的節(jié)點(diǎn)機(jī)安裝和配置
5.4.5網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)的服務(wù)器配置
5.4.6網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)的tftp設(shè)置
5.4.7網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)的內(nèi)核選擇
5.4.8網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)的有關(guān)問題
5.5網(wǎng)卡捆綁
5.5.1為何需要網(wǎng)卡捆綁
5.5.2網(wǎng)卡捆綁的原理
5.5.3網(wǎng)卡捆綁的實(shí)現(xiàn)
5.5.4網(wǎng)卡捆綁的內(nèi)核選擇
5.5.5網(wǎng)卡捆綁的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)
5.6節(jié)點(diǎn)機(jī)該啟動(dòng)哪些進(jìn)程
5.6.1Linux的啟動(dòng)過程
5.6.2初始化控制表inittab
5.6.3啟動(dòng)進(jìn)程文件boot
5.6.4運(yùn)行級(jí)別runlevel
5.6.5啟動(dòng)服務(wù)文件rc
5.6.6啟動(dòng)服務(wù)目錄rc.d
5.6.7啟動(dòng)節(jié)點(diǎn)機(jī)進(jìn)程
第6章微機(jī)集群的任務(wù)管理
6.1OpenPBS概述
6.1.1任務(wù)管理的必要性
6.1.2OpenPBS的管理功能
6.2OpenPBS執(zhí)行碼
6.2.1OpenPBS執(zhí)行碼的獲取
6.2.2OpenPBS執(zhí)行碼的安裝
6.2.3OpeneBS執(zhí)行碼的局限
6.3OpenPBS源代碼的編譯安裝
6.3.1解開源代碼
6.3.2安裝Tcl-devel工具
6.3.3編譯設(shè)置
6.3.4編譯
6.3.5安裝
6.4OpenPBS的啟動(dòng)和停止
6.4.1pbs_server的第一次啟動(dòng)
6.4.2pbs_mom在節(jié)點(diǎn)機(jī)的啟動(dòng)
6.5OpenPBS的命令
6.5.1qmgr命令
6.5.2qmgr命令的常用功能
6.6OpenPBS的簡(jiǎn)單設(shè)置
6.6.1最簡(jiǎn)單的queue的設(shè)置
6.6.2最簡(jiǎn)單的server的設(shè)置
6.6.3最簡(jiǎn)單的node的設(shè)置
6.6.4調(diào)度(scheduling)設(shè)置
6.6.5PBS簡(jiǎn)單設(shè)置的實(shí)例
6.7OpenPBS的工作目錄和主要文件
6.7.1PBS目錄中的關(guān)鍵文件
6.7.2sched_priv目錄
6.7.3server_priv目錄
6.7.4mom_priv目錄
6.8OpenPBS的用戶命令
6.8.1用戶腳本例子
6.8.2用戶任務(wù)的遞交
6.8.3用戶任務(wù)的刪除
6.8.4用戶任務(wù)的查詢
6.9OpenPBS兩個(gè)重要的批處理文件
6.9.1prologue和epilogue文件
6.9.2命令行參數(shù)的意義
6.9.3環(huán)境變量的意義
附錄ALinux系統(tǒng)基礎(chǔ)
A.1基本Shell命令
A.1.1文件概念
A.1.2Linux基本指令
A.2vi編輯器
A.2.1vi的基本操作
A.2.2vi的命令模式
A.2.3全局搜索替換
A.3Shell腳本程序
A.3.1Shell腳本簡(jiǎn)介
A.3.2Shell變量及其運(yùn)算
A.3.3流程控制
A.3.4bash介紹
A.4make工具
A.4.1程序的編譯
A.4.2make的功能
A.4.3make工作流程
A.4.4makefile文件
A.5軟件包管理器rpm
A.5.1主要選項(xiàng)
A.5.2安裝
A.5.3卸載
A.5.4查詢
附錄B微機(jī)集群的硬件選擇
B.1計(jì)算節(jié)點(diǎn)
B.1.1服務(wù)器還是微機(jī)
B.1.2CPU
B.1.3主流CPU比較
B.1.4雙CPU的利弊
B.1.5內(nèi)存
B.1.6主機(jī)板
B.2網(wǎng)絡(luò)硬件
B.2.1以太網(wǎng)
B.2.2Myrinet
B.2.3網(wǎng)卡
B.2.4交換機(jī)
B.3其他
B.3.1散熱
B.3.2機(jī)柜.機(jī)箱
B.3.3電源
后記