生物信息學：中譯本

序
原版前言
縮略語
A 生物信息學概述
A1生物信息學的范圍
A2生物信息學與互聯網
A3有用的生物信息學WWW網站
B 數據采集
B1DNA、RNA和蛋白質測序
B2蛋白質結構的確定
B3基因和蛋白質表達數據
B4蛋白質互作數據
C 數據庫——內容、結構和注釋
C1文件格式
C2已注釋的序列數據庫
C3基因組和特定物種的數據庫
C4其他數據庫
D 生物數據檢索
D1通過Entrez和 DBGET/LINKDB的數據檢索
D2使用SRS（序列檢索系統(tǒng)）的數據檢索
E 通過序列相似性標準搜索序列數據庫
E1序列相似性搜索
E2氨基酸替代矩陣
E3數據庫搜索：FASTA和 BLAST
E4序列過濾程序
E5數據庫的迭代搜索和PSI-BLAST
F 多序列聯配：基因和蛋白質家族
F1多序列聯配和家族關系
F2蛋白質家族和模式數據庫
F3蛋白質結構域家族
G 系統(tǒng)發(fā)育學
G1系統(tǒng)發(fā)育學、遺傳分類學和存在論
G2構建系統(tǒng)發(fā)育樹
G3大分子序列進化
H 序列注釋
H1基因組注釋原理
H2注釋工具和資源
I 結構信息學
I1蛋白質結構的概念模型
I2蛋白質三維結構與蛋白質功能的關系
I3蛋白質結構和功能的進化
I4獲取、觀察和分析結構數據
I5結構聯配
I6 已知三維結構的蛋白質分類：CATH與SCOP
I7蛋白質結構預測簡介
I8通過比較建模預測結構
I9二級結構預測
I10高級蛋白質結構預測與預測策略
J 微陣列數據分析
J1微陣列數據：分析方法
J2微陣列數據：工具和資源
J3序列采樣和SAGE
K 蛋白質組數據分析
K1雙向凝膠電泳數據分析
K2蛋白質質譜數據分析
L 高階模型
L1分子途徑的建模與重建
L2蛋白質互作生物信息學
L3高階模型
M 生物學中的化學信息學
M1分子表示的規(guī)范
M2化學信息學資源
N 制藥業(yè)中的生物信息學
N1生物信息學和藥物發(fā)現
N2藥物信息學資源
O 生物信息學計算的基本原理
O1運行計算機軟件
O2計算機操作系統(tǒng)
O3軟件下載和安裝
O4數據庫管理
進一步閱讀文獻
術語表