執(zhí)行摘要
建議
建議的理由
生物學的首要地位
不可預測性
未來前景
1 領域的性質
引言
數(shù)學與生物學的交叉
近年來有什么變化?
計算生物學問題困難的原因是什么?
數(shù)學與生物科學成功互動的常見因素
為改善兩個領域的利益協(xié)作打好基礎
本報告的結構
參考文獻
2 歷史上的成功
種群生物學的開端
通過同源性推斷基因功能
種群進化過程
建模
醫(yī)學和生物學成像
總結
參考文獻
3 了解分子
引言
數(shù)學生物學關系
分子的數(shù)學應用領域
序列分析
結構分析
動力學
相互作用
未來方向
參考文獻
4 了解細胞
引言
這些問題的范例
細胞結構
細胞網絡及其功能的發(fā)現(xiàn)
從網絡到細胞功能
從細胞到組織
數(shù)據(jù)整合
生物學方面的考慮
未來方向
參考文獻
5 了解生物體
心臟生理學
循環(huán)生理學
呼吸生理學
信息處理
內分泌生理學
形態(tài)發(fā)生和模式生成
運動
癌癥
針對靶向腫瘤細胞的治療輸送
藥物作用的機制
細胞群體的生長和分化
抗性的發(fā)展
HIV-1感染的體內動力學
未來方向
參考文獻
6 了解種群
種群遺傳學
種群的生態(tài)方面
生態(tài)學與進化論的綜合
參考文獻
7 了解群落和生態(tài)系統(tǒng)
計算
未來方向
參考文獻
8 橫切主題
“小n,大P”問題
發(fā)現(xiàn)基因表達數(shù)據(jù)中的模式
有監(jiān)督學習
無監(jiān)督學習
有序系統(tǒng)的分析
隱馬爾可夫模型在DNA、RNA和蛋白質序列分析中的應用
序列譜隱馬爾可夫模型
基因發(fā)現(xiàn)中的隱馬爾可夫模型
蒙特卡羅方法在計算生物學中的應用
模體發(fā)現(xiàn)中的吉布斯采樣
調控網絡的推斷
蛋白質構象采樣
目前引入的數(shù)學主題的經驗教訓
低級數(shù)據(jù)的處理
結束語
參考文獻