現(xiàn)代制藥工藝學

第1章 合成生物學
1.1 概述
1.1.1 合成生物學概念
1.1.2 合成生物學基礎(chǔ)
1.2 合成生物的元器件
1.2.1 基因元件
1.2.2 生物元器件文庫
1.3 合成生物學的發(fā)展
1.3.1 合成生物學發(fā)展的主要事件
1.3.2 合成生物學的主要研究內(nèi)容
1.3.3 合成生物學的學術(shù)活動
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第2章 制藥的工程生物系統(tǒng)
2.1 大腸桿菌表達系統(tǒng)
2.1.1 大腸桿菌的生物學特性
2.1.2 常用蛋白質(zhì)表達底盤菌株
2.1.3 大腸桿菌的表達載體
2.1.4 大腸桿菌表達系統(tǒng)的應(yīng)用
2.2 谷氨酸棒桿菌表達系統(tǒng)
2.2.1 谷氨酸棒桿菌的生物學特性
2.2.2 谷氨酸棒桿菌的表達載體
2.2.3 谷氨酸棒桿菌表達系統(tǒng)的應(yīng)用
2.3 鏈霉菌表達系統(tǒng)
2.3.1 鏈霉菌的生物學特性
2.3.2 鏈霉菌的表達載體
2.3.3 鏈霉菌表達系統(tǒng)的應(yīng)用
2.4 酵母表達系統(tǒng)
2.4.1 酵母的生物學特性
2.4.2 酵母的表達載體
2.4.3 酵母表達系統(tǒng)的應(yīng)用
2.5 植物表達系統(tǒng)
2.5.1 植物細胞的特點
2.5.2 植物表達載體結(jié)構(gòu)
2.5.3 植物表達系統(tǒng)的應(yīng)用
2.6 動物表達系統(tǒng)
2.6.1 制藥動物細胞系
2.6.2 動物表達載體
2.6.3 動物表達系統(tǒng)的應(yīng)用
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第3章 生物元器件的設(shè)計與表征
3.1 基因轉(zhuǎn)錄裝置與蛋白質(zhì)翻譯裝置
3.1.1 基因轉(zhuǎn)錄裝置
3.1.2 翻譯裝置
3.2 RNA聚合酶的設(shè)計與表征
3.2.1 T7RNA聚合酶的正交轉(zhuǎn)錄設(shè)計
3.2.2 T7RNA聚合酶的合理使用
3.2.3 全局轉(zhuǎn)錄裝置工程
3.2.4 RNA聚合酶的表征
3.3 啟動子與終止子的設(shè)計與表征
3.3.1 啟動子的組織結(jié)構(gòu)
3.3.2 啟動子的設(shè)計
3.3.3 啟動子的表征
3.3.4 終止子設(shè)計與表征
3.4 核糖體結(jié)合位點和核糖體開關(guān)設(shè)計與表征
3.4.1 核糖體結(jié)合位點的設(shè)計與表征
3.4.2 核糖體開關(guān)的設(shè)計
3.4.3 核糖體工程
3.5 密碼子的選擇與目標基因設(shè)計
3.5.1 基因組的密碼子選擇
3.5.2 基因組的密碼子使用
3.5.3 目標基因的序列設(shè)計
3.5.4 目標基因表達優(yōu)化
3.5.5 包含體的解決策略
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第4章 生物元器件的合成與組裝
4.1 DNA的化學合成
4.1.1 DNA的構(gòu)建單元
4.1.2 DNA的化學合成后處理
4.1.3 DNA的溶解和保存
4.2 PCR與DNA組裝
4.2.1 PCR
4.2.2 PCA
4.2.3 重疊延伸PCR組裝
4.3 基于連接酶的離體組裝
4.3.1 常規(guī)酶切與連接組裝
4.3.2 同尾酶切與連接酶組裝
4.4 同源重組工程組裝
4.4.1 位點特異性重組組裝
4.4.2 大腸桿菌細胞內(nèi)同源重組組裝
4.4.3 酵母細胞內(nèi)同源重組組裝
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第5章 代謝途徑工程制藥
5.1 莽草酸途徑工程
5.1.1 莽草酸的生物合成途徑
5.1.2 酪氨酸的途徑工程
5.1.3 苯丙氨酸及其衍生物途徑工程
5.2 聚酮藥物途徑工程
5.2.1 聚酮生物合成途徑
5.2.2 鏈霉菌合成聚酮類藥物
5.2.3 大腸桿菌合成Ⅰ型聚酮
5.2.4 大腸桿菌合成Ⅱ型聚酮
5.2.5 大腸桿菌合成Ⅲ型聚酮
5.3 萜類藥物途徑工程
5.3.1 萜類藥物的生物合成途徑
5.3.2 萜類藥物的生物合成
5.3.3 酵母合成氫化可的松
5.3.4 微生物合成紫杉二烯
5.3.5 大腸桿菌合成青蒿二烯
5.3.6 釀酒酵母合成青蒿酸
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第6章 基因組工程制藥
6.1 基因組編輯技術(shù)
6.1.1 多重自動化基因組工程
6.1.2 接合組裝基因組工程
6.1.3 動物細胞基因組編輯技術(shù)
6.2 合成基因組
6.2.1 合成基因組的設(shè)計
6.2.2 合成疫苗
6.2.3 合成細菌基因組
6.2.4 合成細菌
6.2.5 合成釀酒酵母基因組
6.3 最小基因組工廠
6.3.1 最小基因組工廠的概念
6.3.2 最小基因組細菌
6.3.3 最小基因組鏈霉菌
6.3.4 最小基因組酵母
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第7章 生物酶催化制藥
7.1 固定化酶制藥
7.1.1 酶固定化技術(shù)的發(fā)展
7.1.2 固定化酶反應(yīng)器及其特點
7.1.3 固定化酶制藥實例
7.2 酶法拆分制藥
7.2.1 脂肪酶手性拆分
7.2.2 環(huán)氧化物水解酶手性拆分
7.2.3 內(nèi)酯水解酶手性拆分
7.2.4 腈水合酶手性拆分
7.3 酶法合成手性制藥
7.3.1 不對稱還原制備手性醇
7.3.2 不對稱還原胺化制備藥物中間體
7.3.3 腈類化合物的生物轉(zhuǎn)化
7.3.4 他汀類藥物關(guān)鍵中間體的酶法制備
7.4 酶催化合成β-內(nèi)酰胺抗生素
7.4.1 β-內(nèi)酰胺類抗生素
7.4.2 青霉素?；?br>7.4.3 頭孢菌素C酰化酶
7.4.4 α-氨基酸酯水解酶
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第8章 固相化學合成制藥
8.1 固相化學合成技術(shù)的發(fā)展
8.1.1 固相合成的基本原理
8.1.2 過渡金屬催化的應(yīng)用
8.1.3 寡糖的合成與分混式合成
8.1.4 組合化學合成與天然產(chǎn)物合成
8.2 固相化學合成多肽
8.2.1 固相合成多肽的基本過程
8.2.2 C端氨基酸與功能性載體的鍵合
8.2.3 保護基
8.2.4 縮合劑
8.2.5 肽鏈的組裝與釋放
8.3 固相化學合成環(huán)肽
8.3.1 均環(huán)肽的合成
8.3.2 雜環(huán)肽的合成
8.3.3 影響環(huán)肽合成的因素
8.4 固相化學合成核酸
8.4.1 固相合成核酸的基本過程
8.4.2 載體與3′端羥基的鍵合
8.4.3 核酸的保護基
8.4.4 活化劑
8.4.5 肽核酸的合成
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第9章 化學藥物合成新技術(shù)
9.1 流動化學技術(shù)制藥
9.1.1 流動化學原理
9.1.2 流動化學合成小分子藥物
9.1.3 流動化學全合成天然產(chǎn)物
9.2 手性記憶技術(shù)制藥
9.2.1 手性記憶的原理
9.2.2 手性記憶合成α-取代氨基酸衍生物
9.2.3 手性記憶用于分子內(nèi)的環(huán)化反應(yīng)
9.2.4 手性記憶用于Aldol反應(yīng)
9.2.5 手性記憶用于自由基反應(yīng)
9.2.6 手性記憶用于重排反應(yīng)
9.2.7 手性記憶用于全合成天然產(chǎn)物
9.3 仿生合成制藥
9.3.1 仿生合成原理
9.3.2 仿生全合成flinderoles
9.3.3 仿生合成長春氟寧
9.4 串聯(lián)反應(yīng)與多組分反應(yīng)制藥
9.4.1 串聯(lián)反應(yīng)
9.4.2 多組分反應(yīng)
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