稻屬植物分蘗控制基因同源區(qū)比較研究

前言
上篇 植物基因組同源區(qū)研究背景知識
1 植物比較基因組學(xué)研究進(jìn)展
1.1 禾本科植物比較基因組學(xué)研究進(jìn)展
1.2 十字花科植物比較基因組學(xué)研究進(jìn)展
2 生物信息學(xué)軟件在基因組測序和注釋中的應(yīng)用
2.1 生物信息學(xué)定義
2.2 基因組學(xué)研究中常用的生物信息學(xué)軟件
2.2.1 序列組裝與質(zhì)量檢測
2.2.2 序列注釋
3 基因組測序與植物分子育種
3.1 基因組定義
3.2 基因組測序策略
3.2.1 BACby。BAC法
3.2.2 全基因組霰彈法
3.3 關(guān)于基因組測序完成標(biāo)準(zhǔn)
3.4 DNA測序新方法
3.4.1 454測序系統(tǒng)(GS系統(tǒng))
3.4.2 GenomeAnalyzer測序系統(tǒng)
3.4.3 SOL，iD測序系統(tǒng)
3.4.4 DNA測序技術(shù)回顧、總結(jié)與展望
3.5 基因組信息在植物分子育種中的應(yīng)用
4 生物倍性進(jìn)化與新基因形成
4.1 生物多倍體化與重新二倍體化
4.2 新基因形成
4.2.1 外顯子重排(exonshuffling)介導(dǎo)的新基因形成
4.2.2 基因復(fù)制(geneduplication)介導(dǎo)的新基因形成
4.2.3 反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座(retrotransposon)介導(dǎo)的新基因形成
4.2.4 可移動元件(mobileelement)介導(dǎo)的新基因形成
4.2.5 橫向基因轉(zhuǎn)移（lateral genetransfer）介導(dǎo)的新基因形成
4.2.6 基因斷裂／融合（gene fusion/fission）介導(dǎo)的新基因形成
4.2.7 從頭形成（de novo origination）
下篇 稻屬植物分蘗控制基因MOC1同源區(qū)比較研究
5稻屬植物分蘗控制基因MOC1同源區(qū)研究選題依據(jù)
5.1 水稻遺傳改良上面臨的主要問題
5.2 解決問題的突破口
5.3 稻屬植物分蘗控制基因MOCI同源區(qū)研究的重要性
6稻屬概況及其基因組學(xué)基礎(chǔ)
6.1 稻屬分類概況及栽培稻起源
6.1.1 稻屬分類研究進(jìn)展
6.1.2 栽培稻起源
6.2 稻屬植物基因組學(xué)基礎(chǔ)
6.2.1 稻屬植物染色體組型的確定
6.2.2 稻屬不同染色體組型間的親緣關(guān)系
7野生稻中的優(yōu)異基因與利用
7.1 野生稻中的優(yōu)異基因
7.2 野生稻中優(yōu)異基因的利用
7.2.1 抗病性
7.2.2 抗蟲性
7.2.3 抗非生物脅迫性
7.2.4 品質(zhì)
7.2.5 產(chǎn)量性狀
7.2.6 細(xì)胞質(zhì)雄性不育基因
8稻屬MOC1同源區(qū)研究手段
8.1 研究材料及工具
8.1.1 植物材料
8.1.2 載體及菌株
8.1.3 分子生物學(xué)試劑
8.1.4 儀器設(shè)備
8.2 研究方法
8,2.1 植物材料的培養(yǎng)
8.2.2 基因組DNA的提取
8.2.3 質(zhì)粒DNA的提取
……
參考文獻(xiàn)
附表
縮略詞