為了揭示蛋白質網絡的動態(tài)特征,酵母的時間序列基因表達譜被用于分離靜態(tài)的蛋白質網絡,進而構建隨時間變化的動態(tài)蛋白質網絡。為了理解蛋白質的關鍵性和聚集性,基因表達譜和亞細胞位置信息被引入蛋白質相互作用網絡中,從而設計了一系列蛋白質復合物挖掘算法和關鍵蛋白質識別算法,并對新提出的算法進行了詳細的、多角度的比較測試??紤]到蛋白質網絡在疾病基因識別過程中所起的巨大作用,本書的后半部分,從蛋白質網絡出發(fā),重點研究了各種疾病基因與蛋白質網絡的關系,提出了一系列與腫瘤等復雜疾病有關的基因識別算法。最后,集中探討了蛋白質網絡研究的新方向。