123,123

內(nèi)容簡(jiǎn)介

　　《Olex2軟件單晶結(jié)構(gòu)解析及晶體可視化》介紹單晶解析基礎(chǔ)理論，應(yīng)用圖形界面化程序Olex2 為平臺(tái)，解析單晶結(jié)構(gòu)。運(yùn)用包括最通用和經(jīng)典的 Direct Methods，Patterson Method 兩種算法，以及新發(fā)展的 Charge Flipping，Intrinsic Phasing，Structure Expansion 和 Dual Space 算法，展示新算法在解析結(jié)構(gòu)方面的優(yōu)勢(shì)。并進(jìn)一步提供同步輻射測(cè)試數(shù)據(jù)以及不同衍射儀原始圖片數(shù)據(jù)還原的處理方法。介紹基于 olex2 插件包括 drawplus，reportplus等的使用，逐步實(shí)現(xiàn)晶體的解析各種晶體學(xué)信息的提取及自動(dòng)生成發(fā)表文章所需要的各種表格及數(shù)據(jù)。提供實(shí)例講解解析晶體結(jié)構(gòu)的完整過程。

作者簡(jiǎn)介

　　魏永革，北京大學(xué)化學(xué)系理學(xué)博士，美國密蘇里大學(xué)-堪薩斯城分?；瘜W(xué)系博士后，現(xiàn)任清華大學(xué)化學(xué)系教授、博士生導(dǎo)師，國家杰出青年基金獲得者。曾兼任中國晶體學(xué)會(huì)理事、中國晶體學(xué)會(huì)小分子專業(yè)委員會(huì)委員。主要從事多金屬氧簇的合成、結(jié)構(gòu)與化學(xué)修飾、多金屬氧簇有機(jī)衍生物化學(xué)、多金屬氧簇的可控分子組裝與超分子自組裝、分子磁學(xué)與分子基磁性材料、光電活性的有機(jī)/無機(jī)雜化分子材料等研究。主持完成國家自然科學(xué)基金重大研究計(jì)劃培育項(xiàng)目“多金屬氧簇亞胺雜化分子光電轉(zhuǎn)換晶態(tài)材料的設(shè)計(jì)合成與性能研究”，國家自然科學(xué)基金杰出青年科學(xué)基金項(xiàng)目“多金屬氧簇及其有機(jī)衍生物化學(xué)”、國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目“Anderson型多金屬氧簇的不對(duì)稱修飾及可控組裝研究”、“有機(jī)無機(jī)雜化的新穎手性多金屬氧簇材料的設(shè)計(jì)合成與性能研究”、“多金屬氧簇脂肪亞胺衍生物與多金屬氧簇簇促進(jìn)的碳?xì)滏I活化和官能團(tuán)化”、“多金屬氧簇納米簇與金屬納米簇的合成、結(jié)構(gòu)、組裝與性能”等5項(xiàng)，國家自然科學(xué)青年基金項(xiàng)目“多金屬氧簇類化合物的化學(xué)修飾-多鉬-氧簇的氮配體官能團(tuán)化”等。發(fā)表SCI收錄論文150余篇，獲得授權(quán)發(fā)明專利10余項(xiàng)。

圖書目錄

第1章 Olex2軟件的介紹、配置、優(yōu)缺點(diǎn)及引用 1
1.1 Olex2軟件的介紹 2
1.2 Olex2的配置 2
1.3 Olex2的圖形化界面及各個(gè)選項(xiàng)卡和按鈕的作用 3
1.4 Olex2基本操作 13
1.5 Olex2的優(yōu)缺點(diǎn) 15
1.6 Olex2的引用 16
1.7 Olex2 的更新 16

第2章單晶衍射點(diǎn)數(shù)據(jù)APEX3與CrysAlisPro還原流程 17
2.1 APEX3數(shù)據(jù)還原過程 18
2.2 CrysAlispro數(shù)據(jù)還原過程 28

第3章 Olex2軟件單晶結(jié)構(gòu)解析整體流程 43
3.1 建立文件夾，運(yùn)行XPREP程序 44
3.2 利用Solve進(jìn)行初解結(jié)構(gòu) 49
3.3 利用Refine進(jìn)行結(jié)構(gòu)精修 52
3.4 給原子進(jìn)行編號(hào)、排序 54
3.5 原子加氫 55
3.6 精修權(quán)重 57
3.7 解析的合理性 58
3.8 生成cif文件及檢測(cè)cif文件 59
3.9 產(chǎn)生結(jié)構(gòu)信息報(bào)告 61
3.10 總結(jié) 62

第4章解析實(shí)例 63
4.1 利用Solve-ShelXS中的重原子法Patterson Method進(jìn)行解析 64
4.2 置換無序處理 79
4.3 手性晶體絕對(duì)構(gòu)型的確定與翻轉(zhuǎn) 91
4.4 孿晶及孿晶矩陣拆分 99
4.5 無序的處理及限制命令的應(yīng)用 108
4.6 晶體空間群變換及對(duì)稱性檢查 115

第5章 cif文件的詳細(xì)解析、檢測(cè)及CCDC號(hào)的申請(qǐng) 123
5.1 cif格式詳細(xì)講解 124
5.2 cif文件的檢測(cè) 133
5.3 cif檢測(cè)出現(xiàn)的A、B等類警告的講解 136
5.4 一些常見A類警告及解決辦法 140
5.5 CCDC號(hào)的申請(qǐng) 143
5.6 CCDC、ICSD的使用 149

第6章晶體結(jié)構(gòu)畫圖 157
6.1 ShelXTL軟件畫圖 158
6.2 Diamond軟件畫圖 170
6.3 Mercury軟件畫圖 175

第7章三維拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析 177
7.1 [Ln(H2O)7][Ln(H2O)5][Co2Mo10H4O38]拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析 178
7.2 (C2N2H10)2[Sr(H2O)5][Co2Mo10H4O38]·2H2O拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析 186
7.3 (C2N2H10)2[Ba(H2O)3][Co2Mo10H4O38]·3H2O拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析 191

參考文獻(xiàn) 198