單細胞測序方法和應用

目錄
第1章 單細胞測序在未來醫(yī)學中的應用 1
一、單細胞研究 1
二、單細胞測序的臨床應用意義 1
三、基本操作流程 3
四、與傳統(tǒng)的基因芯片技術方法的比較 4
五、機遇與挑戰(zhàn) 5
六、小結 5
第2章 超級細胞模型在單細胞表型分類中的應用 6
一、超級細胞模型及其發(fā)展 6
二、單細胞研究面臨的挑戰(zhàn) 6
三、超級細胞模型 9
四、實例解析：超級細胞模型在單細胞轉(zhuǎn)錄組測序中的應用 12
五、小結 15
第3章 微生物單細胞基因組分析 17
一、微生物與非可培養(yǎng)微生物類群 17
二、單細胞基因組分析的基本方法 17
三、全基因組擴增的技術方法 19
四、單細胞全基因組測序應用于不可培養(yǎng)微生物的研究 21
五、小結 22
第4章 單細胞測序在動態(tài)轉(zhuǎn)錄組中的應用 23
一、單細胞轉(zhuǎn)錄組動態(tài)分析的應用價值 23
二、單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的基本原理和步驟 24
三、用于單細胞測序的微流體裝置的開發(fā) 26
四、RNA測序方法的基本步驟 27
五、已發(fā)表的單細胞 RNA測序方法及比較 29
六、分析單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的生物信息學挑戰(zhàn) 36
七、單細胞 RNA測序的應用 36
八、小結 37
第5章 系統(tǒng)免疫學在樹突狀細胞代謝研究中的應用 38
一、系統(tǒng)免疫學簡介 38
二、樹突狀細胞代謝調(diào)控的研究進展 40
三、DC代謝調(diào)控中的系統(tǒng)免疫學 41
四、展望 42
第6章 系統(tǒng)免疫學及調(diào)節(jié)性T淋巴細胞研究 43
一、調(diào)節(jié)性T細胞概述 43
二、系統(tǒng)生物學技術在Treg領域的應用 47
三、展望 51
第7章 幼淋巴細胞-淋巴細胞與生物信息學 52
一、幼淋巴細胞特性 52
二、幼淋巴細胞的蛋白組學 53
三、幼淋巴細胞的基因組學 54
四、幼淋巴細胞與白血病 56
五、白血病特異性生物標志物 57
六、展望 57
第8章 淋巴細胞在肝癌中的作用及其治療利用 58
一、肝癌及其發(fā)病機制研究進展 58
二、肝癌中的TIL亞群 60
三、基于TIL的肝癌治療 62
四、采用高通量技術研究肝癌淋巴細胞 64
五、肝癌中的網(wǎng)絡化調(diào)控和個體化治療 67
六、小結 67
第9章 肝細胞壞死的早期生物標志物 69
一、肝細胞死亡 69
二、凋亡和壞死生物標志物 70
三、微小核糖核苷酸（microRNA） 72
四、線粒體損傷生物標志物 72
五、炎癥生物標志物 73
六、DNA損傷生物標志物 73
七、小結 74
第10章 基于流式細胞儀的單個細胞分選實驗步驟 75
一、單細胞的流式細胞儀分選 75
二、實驗步驟 76
三、小結 78
第11章 分離肺癌單細胞 80
一、單細胞技術和組學科學 80
二、單細胞分離技術 81
三、口吸管顯微操作試驗方案 81
四、小結 82
第12章 腫瘤生物信息學 86
第13章 單細胞異質(zhì)性檢測在腫瘤中的應用 88
一、單細胞異質(zhì)性在腫瘤診斷及治療中的臨床意義 88
二、單細胞異質(zhì)性的檢測對象 89
三、單細胞異質(zhì)性檢測方法 92
四、小結 94
參考文獻 95