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內(nèi)容簡介

　　本書共分為五章內(nèi)容。第一章介紹定量構(gòu)效關(guān)系，并針對(duì)選擇性環(huán)氧合酶抑制劑開展三維定量構(gòu)效關(guān)系研究實(shí)驗(yàn)。第二章以******受體酪氨酸激酶抑制劑為例，對(duì)基于藥效團(tuán)模型虛擬篩選進(jìn)行了詳細(xì)的講解。第三章由七個(gè)獨(dú)立的子實(shí)驗(yàn)組成，內(nèi)容涵蓋了點(diǎn)群計(jì)算、單電能計(jì)算、靜電勢表面計(jì)算等，以方便讀者熟悉和掌握小分子的多種結(jié)構(gòu)優(yōu)化操作。第四章為分子對(duì)接，集中講解了四種常用對(duì)接方法的實(shí)驗(yàn)操作，方便讀者掌握不同對(duì)接方法的軟件操作和結(jié)果分析。第五章以“普瑞巴林”和“MDM2-抑制劑復(fù)合物”為研究對(duì)象，對(duì)分子動(dòng)力學(xué)模擬實(shí)驗(yàn)操作進(jìn)行講解。

作者簡介

暫缺《計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)教程》作者簡介

圖書目錄

第一章定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?br /> 二、實(shí)驗(yàn)要求
三、實(shí)驗(yàn)原理
1 比較分子力場分析方法(CoMFA)
2 比較分子相似性指數(shù)分析方法((CoMSIA)
四、實(shí)驗(yàn)內(nèi)容
1 背景介紹
2 實(shí)驗(yàn)操作
【參考文獻(xiàn)】
第二章藥效團(tuán)模型
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?br /> 二、實(shí)驗(yàn)要求
三、實(shí)驗(yàn)原理
1 藥效團(tuán)特征的種類
2 藥效團(tuán)模型的構(gòu)建
3 基于藥效團(tuán)模型藥物設(shè)計(jì)方法的應(yīng)用
四、實(shí)驗(yàn)內(nèi)容
1 背景介紹
2 實(shí)驗(yàn)操作
【參考文獻(xiàn)】
第三章結(jié)構(gòu)優(yōu)化
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?br /> 二、實(shí)驗(yàn)要求
三、實(shí)驗(yàn)原理
四、實(shí)驗(yàn)內(nèi)容
1 構(gòu)建化合物并優(yōu)化結(jié)構(gòu)
2 保證水分子的C2v1點(diǎn)群
3 保證Ge6的Dh對(duì)稱性計(jì)算
4 同分異構(gòu)體的單點(diǎn)能計(jì)算
5 靜電勢表面ESF(Electrostatic potential surfaces)計(jì)算
6 觀察分子振動(dòng)
7 預(yù)測紅外光譜和拉曼光譜
第四章分子對(duì)接
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?br /> 二、實(shí)驗(yàn)要求
三、實(shí)驗(yàn)原理
四、實(shí)驗(yàn)內(nèi)容
1 LibDock對(duì)接方法及蛋白一配體相互作用的打分評(píng)價(jià)
2 CDOCKER和對(duì)接姿態(tài)分析
3 SYBYL軟件的分子對(duì)接模塊Smflex-Dock
4 MOE軟件的分子對(duì)接模塊I)ock
5 總結(jié)
【參考文獻(xiàn)】
第五章分子動(dòng)力學(xué)模擬
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?br /> 二、實(shí)驗(yàn)要求
三、實(shí)驗(yàn)原理
四、實(shí)驗(yàn)內(nèi)容
1 普瑞巴林的溶劑化模型及分子動(dòng)力學(xué)模擬
2 MIDM2一抑制劑復(fù)合物的分子動(dòng)力學(xué)模擬
【參考文獻(xiàn)】