植物代謝組學(xué)：方法與應(yīng)用（第二版）

第1章　概述 001
1.1　代謝物分析技術(shù)的發(fā)展趨勢 003
1.2　代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析現(xiàn)狀及其面臨的挑戰(zhàn) 008
1.3　植物代謝組學(xué)的應(yīng)用 013
參考文獻(xiàn) 019
第2章　代謝組學(xué)分析技術(shù)：氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù) 026
2.1　GC-MS聯(lián)用的原理和關(guān)鍵技術(shù) 027
2.2　樣品制備和分析技術(shù) 035
2.3　新技術(shù)、發(fā)展趨勢 039
2.4　常見問題，注意事項(xiàng) 041
2.5　展望 044
參考文獻(xiàn) 045
第3章　代謝組學(xué)分析技術(shù)：液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù) 047
3.1　LC-MS基本原理 048
3.2　數(shù)據(jù)解讀 052
3.3　新技術(shù)與發(fā)展趨勢 053
3.4　常見問題和注意事項(xiàng) 057
3.5　展望 061
參考文獻(xiàn) 061
第4章　代謝組學(xué)分析技術(shù)：核磁共振技術(shù) 064
4.1　核磁共振發(fā)展概況 065
4.2　核磁共振基本原理 065
4.3　核磁共振波譜儀 067
4.4　化學(xué)位移 068
4.5　自旋耦合 075
4.6　常見基團(tuán)的化學(xué)位移范圍 076
4.7　代謝組學(xué)研究中常用的二維譜 082
4.8　核磁共振譜圖解析 084
4.9　常見問題及解決方案 095
4.10　植物代謝組學(xué)研究中樣品的提取方法 097
4.11　新技術(shù)及發(fā)展趨勢 098
參考文獻(xiàn) 100
第5章　代謝組學(xué)數(shù)據(jù)預(yù)處理分析方法 102
5.1　NMR數(shù)據(jù)集的預(yù)處理 103
5.2　MS數(shù)據(jù)預(yù)處理 106
參考文獻(xiàn) 113
第6章　基于代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的多變量分析 115
6.1　引言 116
6.2　基于單維統(tǒng)計(jì)模式識(shí)別 116
6.3　多維統(tǒng)計(jì)模式識(shí)別 118
6.4　數(shù)據(jù)模型的識(shí)別和驗(yàn)證 129
6.5　模式識(shí)別的軟件工具 130
6.6　代謝組和其他組學(xué)數(shù)據(jù)的聯(lián)合分析 132
6.7　小結(jié) 140
參考文獻(xiàn) 140
第7章　基于色譜/質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的代謝物定性 144
7.1　引言 145
7.2　常見有機(jī)物質(zhì)譜裂解規(guī)律 148
7.3　GC-MS代謝產(chǎn)物定性方法 150
7.4　LC-MS代謝產(chǎn)物定性方法 157
參考文獻(xiàn) 164
第8章　植物脂質(zhì)組 167
8.1 植物脂質(zhì)簡介 168
8.2 植物脂質(zhì)的功能 176
8.3 植物脂質(zhì)碎裂規(guī)律 179
8.4 植物脂質(zhì)組樣品制備 181
8.5 脂質(zhì)組學(xué)分析工具 183
8.6 多組學(xué)聯(lián)合分析 189
8.7 展望 190
參考文獻(xiàn) 192
第9章　植物代謝網(wǎng)絡(luò) 197
9.1 引言 198
9.2 植物代謝網(wǎng)絡(luò)的特征 199
9.3 植物代謝網(wǎng)絡(luò)的分子生物學(xué)研究 206
9.4 存在問題與展望 212
參考文獻(xiàn) 213
第10章　LC-MS 在植物代謝組學(xué)中的應(yīng)用 220
10.1 分析樣品制備 222
10.2 LC-MS在基因功能研究中的應(yīng)用 223
10.3 代謝組與基因組重測序數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)確定候選基因 228
10.4 應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因植物“實(shí)質(zhì)等同性”檢測 229
參考文獻(xiàn) 233
第11章　NMR 在植物發(fā)育和其應(yīng)答生物/非生物脅迫中的應(yīng)用 235
11.1 引言 236
11.2 NMR在綠豆種子發(fā)育中的應(yīng)用 236
11.3 NMR在水稻抗蟲中的應(yīng)用 243
11.4　NMR在煙草應(yīng)答鹽脅迫中的應(yīng)用 251
11.5 機(jī)遇與挑戰(zhàn) 258
參考文獻(xiàn) 258
第12章　代謝組學(xué)方法在中藥研究中的應(yīng)用 261
12.1 引言 262
12.2 黃芪藥材的多基源鑒別 262
12.3 丹參酮類化合物生物合成途徑解析 274
12.4 天麻硫熏綜合評估分析 282
參考文獻(xiàn) 289
第13章　代謝組數(shù)據(jù)的深度挖掘及應(yīng)用 292
13.1 植物代謝組學(xué)檢測平臺(tái) 293
13.2 植物代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析方法 298
13.3 植物代謝物注釋 306
13.4 植物代謝組學(xué)的應(yīng)用 308
13.5 展望 310
參考文獻(xiàn) 311
附錄　320
附錄1　基于質(zhì)譜的代謝組學(xué): 注釋、定量和報(bào)告實(shí)踐指南 321
附錄2　中英文縮略語表 334