前言
第1章 貝葉斯推斷1 1.1 經典范式1
1.2 貝葉斯范式4
1.3 貝葉斯推斷7
1.3.1 參數(shù)推斷7
1.3.2 預測推斷10
1.4 結論11
習題12第2章 先驗信息表示14 2.1 無信息先驗14
2.2 自然共軛先驗19
習題22第3章 基礎問題中的貝葉斯
推斷24 3.1 二項分布與貝塔模型24
3.2 泊松分布與伽馬模型25
3.3 正態(tài)分布(μ已知)與
逆伽馬模型26
3.4 正態(tài)分布(μ,σ2未知)與
杰弗里斯先驗27
3.5 兩個獨立的正態(tài)模型與
邊緣杰弗里斯先驗28
3.6 兩個獨立的二項分布與
貝塔分布30
3.7 多項分布與狄利克雷模型31
3.8 有限總體中的推斷34
習題35第4章 蒙特卡羅方法推斷38 4.1 簡單蒙特卡羅方法38
4.1.1 后驗概率41
4.1.2 可信區(qū)間41
4.1.3 邊緣后驗分布42
4.1.4 預測匯總44
4.2 重要性抽樣蒙特卡羅方法44
4.2.1 可信區(qū)間47
4.2.2 貝葉斯因子49
4.2.3 邊緣后驗密度51
4.3 序貫蒙特卡羅方法52
4.3.1 動態(tài)狀態(tài)空間模型52
4.3.2 粒子濾波器54
4.3.3 自適應粒子濾波器55
4.3.4 參數(shù)學習56
習題57第5章 模型評估62 5.1 模型評判與充分性62
5.2 模型選擇與比較67
5.2.1 預測性能度量67
5.2.2 通過后驗預測性能進行
選擇71
5.2.3 使用貝葉斯因子進行
模型選擇73
5.3 模型評估中模擬的更多
說明74
5.3.1 評估后驗預測分布74
5.3.2 先驗預測密度估計75
5.3.3 從預測分布中抽樣76
習題77第6章 馬爾可夫鏈蒙特卡羅
方法79 6.1 馬爾可夫鏈的定義和
基本結果80
6.2 梅特羅波利斯-黑斯廷斯
算法82
6.3 吉布斯抽樣器86
6.4 切片抽樣器92
6.5 哈密頓蒙特卡羅93
6.5.1 哈密頓動力學93
6.5.2 哈密頓蒙特卡羅轉移
概率96
6.6 實現(xiàn)細節(jié)99
習題102第7章 模型選擇和跨維
MCMC113 7.1 參數(shù)空間上的MC模擬113
7.2 模型空間上的MC模擬114
7.3 模型和參數(shù)空間上的MC
模擬119
7.4 可逆跳躍MCMC121
習題125第8章 基于解析近似的方法131 8.1 解析方法131
8.1.1 多元正態(tài)后驗近似131
8.1.2 經典拉普拉斯方法134
8.2 潛高斯模型139
8.3 積分嵌套拉普拉斯近似141
8.4 變分貝葉斯推斷143
8.4.1 后驗近似143
8.4.2 坐標上升算法144
8.4.3 自動微分變分推斷147
習題147第9章 軟件151 9.1 應用實例151
9.2 BUGS項目:WinBUGS和
OpenBUGS152
9.2.1 應用實例:
使用R2OpenBUGS154
9.3 JAGS159
9.3.1 應用實例:
使用R2jags160
9.4 Stan163
9.4.1 應用實例:
使用RStan164
9.5 BayesX171
9.5.1 應用實例:
使用R2BayesX172
9.6 收斂性診斷:CODA程序和
BOA程序176
9.6.1 收斂性診斷176
9.6.2 CODA包和BOA包178
9.6.3 應用實例:
CODA和BOA180
9.7 R-INLA和應用實例190
9.7.1 應用實例192
習題198附錄200
附錄A200
附錄B206索引209參考文獻213