磷與生命起源

1生命起源的研究概況 001
1.1生命起源假說 002
1.1.1RNA世界 003
1.1.2HCN與生命起源 007
1.1.3冰晶與生命起源 010
1.1.4海洋與生命起源 011
1.2磷與生命起源 016
1.2.1磷的原始來源 018
1.2.2前生源環(huán)境下的有效磷源 021
1.3生命起源——人類永恒的奧秘，探索未知世界的動力 023
參考文獻 024
2核苷酸的前生源化學(xué)合成 029
2.1核苷酸的組成 030
2.2核糖核苷酸的前生源逆合成法 032
2.2.1堿基的合成 032
2.2.2糖類的合成 033
2.2.3糖苷鍵及磷脂鍵的合成 034
2.3核糖核苷酸以及脫氧核糖核苷酸的系統(tǒng)化學(xué)合成法 038
2.3.1嘧啶核糖核苷酸的合成 038
2.3.2嘌呤脫氧核糖核苷酸的合成 041
參考文獻 043
3蛋白質(zhì)的前生源化學(xué)起源 045
3.1多肽前生源化學(xué)合成途徑概況 046
3.1.1早期地球前生源的環(huán)境概況 046
3.1.2多肽前生源化學(xué)合成途徑 047
3.2磷參與下的多肽前生源化學(xué) 054
3.2.1磷促進氨基酸的前生源合成 054
3.2.2磷促進多肽的前生源合成 055
參考文獻 057
4氨基酸-磷酸混合酸酐的形成及其反應(yīng) 063
4.1連續(xù)性原則 064
4.2氨基酸-磷酸混合酸酐的前生源合成 066
4.2.1氨基酸及其衍生物的前生源活化 067
4.2.25′-磷酸核苷酸與N-羧基環(huán)內(nèi)酰胺的反應(yīng)及混合酸酐穩(wěn)定性 072
4.2.35′-磷酸核苷酸與5(4H)-唑酮的反應(yīng)及手性選擇性 073
4.3氨基酸核酸酯或核苷酸酯的前生源合成 074
4.4氨基酸與核苷酸的同時活化 078
4.5RNA世界假說與蛋白質(zhì)-核酸共起源 080
參考文獻 081
5高能P-N鍵調(diào)控的核酸、蛋白質(zhì)、膜的共起源 083
5.1高能P-N鍵的化學(xué)特性及生物學(xué)意義 084
5.1.1磷酸化精氨酸 087
5.1.2磷酸化組氨酸 087
5.1.3磷酸化賴氨酸 088
5.2高能P-N鍵和蛋白質(zhì)的化學(xué)起源與演化 089
5.2.1氨基酸的前生源形成 090
5.2.2前生源環(huán)境下的氨基酸成肽反應(yīng) 091
5.2.3磷化學(xué)與前生源多肽的形成 093
5.2.4N-磷?；被?094
5.2.5磷參與α-氨基酸的自然選擇 097
5.3高能P-N鍵與核酸、蛋白質(zhì)共起源 103
5.4N-磷酸化氨基酸與細(xì)胞膜起源 105
5.4.1細(xì)胞膜前生源獲得途徑概況 106
5.4.2N-磷?；被崤c細(xì)胞膜起源的關(guān)系 112
5.4.3原始細(xì)胞膜的進化 118
5.4.4基于P-N鍵的核酸、蛋白質(zhì)、細(xì)胞膜共起源理論 118
參考文獻 121
6高能P-N鍵介導(dǎo)的功能二肽的發(fā)現(xiàn) 127
6.1Ser-His對DNA的水解活性 128
6.2Ser-His對蛋白質(zhì)的水解活性 131
6.3Ser-His與底物蛋白質(zhì)相互作用的雙功能性 133
6.4Ser-His與絲氨酸蛋白水解酶的分子進化關(guān)系 134
6.5絲組二肽——現(xiàn)代酶的原始進化雛形 139
6.6絲組二肽新功能的發(fā)現(xiàn) 140
參考文獻 141
7磷調(diào)控下的遺傳密碼起源與同手性起源 143
7.1遺傳密碼化學(xué)起源研究概況 144
7.2N-磷酸化氨基酸與遺傳密碼起源 146
7.2.1化學(xué)起源模型的建立 146
7.2.2核苷與二肽生成量的關(guān)系評價 150
7.3生命體同手性的自然選擇  160
7.3.1氨基酸、核苷的同手性選擇 160
7.3.2五配位磷中心的手性研究 161
7.3.3氨基酸與核苷酸的相互作用 169
7.3.4基于磷化學(xué)同手性起源化學(xué)模型的建立 170
參考文獻 172
8ATP等輔因子與蛋白質(zhì)起源 177
8.1ATP-氨基酸相互作用 178
8.1.1ATP的結(jié)構(gòu)及與氨基酸的相互作用 178
8.1.2基于質(zhì)譜技術(shù)的ATP與氨基酸的弱相互作用研究 179
8.1.3基于熒光光譜技術(shù)的ATP與氨基酸的弱相互作用研究 182
8.1.4基于核磁共振技術(shù)的ATP與氨基酸的弱相互作用研究 184
8.1.5ATP與氨基酸的弱相互作用的理論分析 185
8.2最古老的蛋白質(zhì)——ATP結(jié)合蛋白的發(fā)現(xiàn)及意義 189
8.2.1蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)分子化石 190
8.2.2輔因子分子化石和蛋白質(zhì)起源的小分子誘導(dǎo)/選擇模型 192
8.2.3輔因子促進原始蛋白質(zhì)形成 195
8.2.4小分子標(biāo)定的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分子鐘 196
8.2.5使用金屬輔因子的早起源蛋白質(zhì) 198
參考文獻 198
9磷與代謝起源——系統(tǒng)生物學(xué)研究 203
9.1磷在原始代謝中的作用 204
9.2磷與代謝網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 206
9.2.1無磷代謝網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 206
9.2.2磷依賴代謝網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 207
9.3磷依賴代謝網(wǎng)絡(luò)起源 210
9.4磷依賴代謝網(wǎng)絡(luò)功能分析 214
9.5磷對代謝網(wǎng)絡(luò)擴張的熱力學(xué)影響 217
參考文獻 222
10原始細(xì)胞——非生命物質(zhì)與生命體之間的橋梁 227
10.1原始細(xì)胞 228
10.1.1原始細(xì)胞研究概述 228
10.1.2原始細(xì)胞的構(gòu)建原則和策略 231
10.2原始細(xì)胞的類型 234
10.2.1脂肪酸體系 235
10.2.2凝聚物體系  239
10.2.3雜化原始細(xì)胞 245
10.2.4類蛋白微球體系 246
10.2.5其他類型的原始細(xì)胞 247
10.3原始細(xì)胞的群體行為 254
10.3.1化學(xué)信息交流 254
10.3.2捕食行為  255
10.3.3原生組織 257
10.4結(jié)論 260
參考文獻 261
11磷與地外生命探索 269
11.1地外生命探索的傳統(tǒng)印記 271
11.1.1氣體生命印記 271
11.1.2表面生命印記 274
11.1.3時間生命印記 277
11.2磷是否可以作為生命探尋的有效印跡 279
11.2.1磷與地球生命起源 279
11.2.2磷與地外生命探索 281
參考文獻 286
索引  290