徐樹(shù)錚字又錚、幼錚，號(hào)鐵珊，江蘇蕭縣人。少有神童之譽(yù)，年廿二間關(guān)至山東投靠袁世凱，踵轅上書，值袁喪居，命道員朱鐘琪代見(jiàn)，未得結(jié)果，住在濟(jì)南的高升店，旅居無(wú)聊，在廳堂寫楹聯(lián)，時(shí)值嚴(yán)冬，徐僅著夾袍，可是并沒(méi)有寒酸氣。這天段祺瑞剛好到高升店訪友，見(jiàn)徐氣宇不凡，乃探問(wèn)其姓名，徐告以投友不遇，盤纏用罄，正在等候家款。段問(wèn)其愿就事否？徐答以：“值得就則可就”。段乃約徐長(zhǎng)談，聘徐擔(dān)任文牘工作，從此畢生追隨段祺瑞。袁世凱任北洋大臣，段督辦陸軍各學(xué)校，徐雖擔(dān)任文員職務(wù)，但時(shí)與兵士習(xí)跑步，同操作，后赴日本入士官學(xué)校，回國(guó)后仍在段左右，領(lǐng)袖群僚，不僅是段的靈魂，簡(jiǎn)直是段的化身。段一生剛愎，有人說(shuō)段是剛愎“他”用，這他，就是指徐樹(shù)錚。
北洋時(shí)代有大徐小徐，大段小段，所謂大徐是徐世昌，小徐就指徐樹(shù)錚，大段是段祺瑞，小段是指段芝貴。
小徐如何影響段祺瑞，如何操縱運(yùn)用，可自一則筆記中看出，這是段的另一智囊曾毓雋所敘袁世凱稱帝時(shí)和段祺瑞鬧僵的一幕，曾毓雋因?yàn)槭嵌紊磉吽H信的人物，他的描敘自然很近事實(shí)：
?。ㄔ闺h言：）項(xiàng)城蓄謀帝制之始，合肥微窺其隱，即召余（曾自稱）及又錚諸人秘商曰：“項(xiàng)城帝制自為之跡，已漸顯露。我當(dāng)年曾采取共和之電，如今又擁項(xiàng)城登基把認(rèn)識(shí)限制在感覺(jué)的范圍內(nèi)。還力圖超越主客觀的對(duì)立、把，國(guó)人其謂我何？且恐二十四史中，亦再找不出此等人物！所以論公，我寧死亦不參與，論私，我從此只有退休，決不多發(fā)一言”。
后來(lái)帝制形成，合肥養(yǎng)病京郊。一夕，項(xiàng)城忽召余曰：“松坡已離京轉(zhuǎn)滇，芝泉亦知之乎？為我轉(zhuǎn)告芝泉，此時(shí)忍坐視我滿頭白發(fā)，遭人摧毀欺負(fù)耶？”繼又忿然曰：“沒(méi)有我，恐怕也沒(méi)有你們！我今年逾五十，位極元首，個(gè)人尚有何求？然不能不為此一團(tuán)體打算，我們不能讓人家打到大門口來(lái)！即有錯(cuò)誤，第一個(gè)了解我，又能諒解我的，應(yīng)該是芝泉。今乃剛剛相反，芝泉竟是第一個(gè)不了解我，不諒解我的。實(shí)令人不解！汝可轉(zhuǎn)告他”。
繼又曰：“最好芝泉能親自來(lái)見(jiàn)我”。于是提筆草就一函。交余遞段。段閱后決定仍不往見(jiàn)，囑余擬稿，加以矯正，交余面呈項(xiàng)城。于是我又往謁項(xiàng)城，作第二次之密談。袁拆函一瞥，隨命余曰：“汝且退，明日此時(shí)，可再來(lái)此”。
余謁段報(bào)告見(jiàn)袁經(jīng)過(guò)，段曰：“汝明日復(fù)謁項(xiàng)城，不必多費(fèi)一詞，只聽(tīng)其發(fā)付可也。生死且不計(jì)，何有于得失！”
余歸，竟夕不能成寐，想找又錚諸人一商，則又錚實(shí)為與合肥同一鼻孔出氣之人。且合肥此種堅(jiān)決態(tài)度，十之七八受又錚影響為多。乃作罷。
余謁合肥，請(qǐng)其在可能范圍內(nèi)予以便宜行事。段鄭重聲明曰：“除不擁護(hù)項(xiàng)城做皇帝，及暫不謁見(jiàn)外，其他均可便宜行事?！庇殖邢喔嬖唬骸白蛲碛皱P來(lái)稱：項(xiàng)城左右，已亟謀不利于我，并及又錚。聞他們只待上面點(diǎn)頭，便采取行動(dòng)。我料此乃想當(dāng)然事，但亦不可不防范之?！?br/>
我離合肥處后，頗有歧路徘徊之感。繼思又錚畢竟權(quán)奇倜儻人也，不如試一探詢其本意，然后請(qǐng)其相助。因逕往某俱樂(lè)部見(jiàn)又錚，坦白告以一切經(jīng)過(guò)。又錚笑曰：“閣下誠(chéng)坦白，但尚隱有一事，即項(xiàng)城大罵徐樹(shù)錚該死是也。”余亦笑曰：“事誠(chéng)有之，何必贅述，以攖君之怒。”我乃更告以項(xiàng)城與合肥各執(zhí)一端，無(wú)法向項(xiàng)城復(fù)命之苦，請(qǐng)智多星為我設(shè)想。又錚先說(shuō)笑……見(jiàn)余若有不豫色然者，始正經(jīng)為計(jì)曰：“閣下明日仍先謁項(xiàng)城，告以合肥擬俟稍愈，即親謁面呈密要。項(xiàng)城能得與合肥面談，必喜且不勝，然后吾人徐圖補(bǔ)救。茲事體大，不可造次。”余覺(jué)又錚所言極是，次日再謁項(xiàng)城?！?br/>
此次謁項(xiàng)城為第三度。見(jiàn)袁后即告曰：“段以茲事體大，決俟病體稍愈，躬親請(qǐng)謁，而呈一切?！庇止室饧又卣Z(yǔ)氣，重說(shuō)曰：“親來(lái)密商，比較方便。覺(jué)其病狀已好轉(zhuǎn)，大約最短期內(nèi)即可應(yīng)命前來(lái)?！表?xiàng)城聽(tīng)到最短期內(nèi)可以會(huì)晤，立刻變?yōu)橄矏?。我正想乘機(jī)告退，但項(xiàng)城準(zhǔn)備發(fā)言了。他一發(fā)問(wèn)，問(wèn)題便多。我暗中在咎又錚：凡所作計(jì)，總帶幾分冒險(xiǎn)性質(zhì)。正在冥想，見(jiàn)項(xiàng)城檢交馮華甫親筆函曰，汝試一閱，必覺(jué)其真有進(jìn)步。我讀后，記函中警句云：“京以外事，倘有所命，決不敢辭。惟京內(nèi)事，則極望菊人、芝泉諸兄能切實(shí)秉命而行，不要為其左右所誤?！贝艘徽Z(yǔ)明明系指合肥之信任又錚，最中項(xiàng)城之忌。我不待項(xiàng)城發(fā)言，即批評(píng)該函云：“無(wú)論東海、河間、合肥，皆屬國(guó)家柱石，似應(yīng)同心協(xié)力，三位一體。……如相互猜忌，則恐禍起蕭墻，非國(guó)家之福。”項(xiàng)城云：可為我將華甫此意，轉(zhuǎn)告芝泉。旋又急曰：“且慢，又錚其人，亦小有才，如循正軌，可期遠(yuǎn)到。但傲岸自是，開(kāi)罪于人特多。芝泉如愛(ài)之，不應(yīng)反以害之?！嗫蔀槲肄D(zhuǎn)加勉勵(lì)，并可將去此函共閱。”
余自公府辭出后，即見(jiàn)合肥，告以已代為權(quán)允病愈后往謁面談。并遞上河間致項(xiàng)城手函。合肥看罷，即擲之于地曰：
“馮華甫本來(lái)是狗，現(xiàn)在看來(lái)，簡(jiǎn)直連狗不如！”
我說(shuō)既已權(quán)允病愈往見(jiàn)，則不能稱病到底，事先應(yīng)有準(zhǔn)備才好。合肥曰：“又錚來(lái)過(guò)，亦為此事?lián)?，汝可找又錚共商?！?br/>
我找到又錚，出示馮函，又錚曰：“我們還是抓定自己的原則，即第一：不論直接間接，積極消極，均反對(duì)帝制到底。第二：欲項(xiàng)城中途取消稱帝野心，據(jù)張季老相告，已完全失望。所以合肥還是始終稱病不見(jiàn)為上?！蔽曳瘩g曰：“不見(jiàn)固佳，但不能稱病到底。”又錚思之有頃，忽拍案叫曰：“得矣，我可派人揚(yáng)言于梁燕孫、楊皙子輩：‘只要合肥愿見(jiàn)項(xiàng)城，項(xiàng)城可答允合肥一切要求，所謂要求，包括人事調(diào)整’云云。彼輩一聞此言，恐被指名調(diào)整，必多方設(shè)法以緩項(xiàng)城與合肥之見(jiàn)面，則吾人可從容坐視其變?！?br/>
余每暗服徐之勇邁而兼有雅量。因一再相約曰：“一切如君所論，但請(qǐng)從速進(jìn)行。”
果然，此后多日，項(xiàng)城不再召我，又錚之謀告成矣。
忽一夕梁燕孫過(guò)訪……曰：“頃間項(xiàng)城相告，謂據(jù)足下轉(zhuǎn)陳，合肥已允病愈往謁。果能如此，何事不可商量。第一，馮華甫即不敢再如目前之作壁上觀，而將一切責(zé)任推諸合肥身上。第二，東南西南各省督使，對(duì)我方必立刻改變觀念，而有所顧慮，以共尋求緩沖之道。則項(xiàng)城做不做皇帝，均得有時(shí)間從長(zhǎng)計(jì)議?！蔽掖鹪唬骸昂戏室褯Q定病愈往謁，但項(xiàng)城左右，恐非每個(gè)人都如閣下想法。……合肥個(gè)性，閣下所知，決不可供群小玩弄?！绷菏显疲骸白阆轮允且?，容將此意往陳項(xiàng)城，得其了解，再來(lái)就商?！?br/>
梁去后，余即往告又錚，徐曰：“有我徐某在，決不令此獠猖獗禍國(guó)也?！?br/>
我問(wèn)曰：“君謂南皮項(xiàng)城，是半豪杰，作何解？”徐曰：“南皮一生，以罵人起家。項(xiàng)城一生，以騙人起家。非豪杰不敢以罵人，非豪杰不足以騙人。然真豪杰，則既不罵人，更不騙人。今南皮與項(xiàng)城一罵人，一騙人，吾故曰半豪杰也。豪杰而曰半者，其他一半，屬屠沽故也。”徐氏述畢，關(guān)于梁燕孫與我晤談之應(yīng)付，又錚毅然曰：“我料梁氏旨在窺探吾人意向，暫時(shí)決不會(huì)慫恿項(xiàng)城召見(jiàn)閣下。因我所做工夫重點(diǎn)，即在投彼輩所好，可使項(xiàng)城一時(shí)更不圖見(jiàn)合肥，請(qǐng)君高枕看我好謀?！蔽疑钚庞皱P之能，遂亦置之。
項(xiàng)城欲與合肥見(jiàn)面，終因又錚窺破項(xiàng)城左右意圖，略施拖延小計(jì)。不久蔡松坡云南起義，項(xiàng)城亦勢(shì)成騎虎，不能登其大寶。
某夕。又錚過(guò)訪，謂項(xiàng)城又有請(qǐng)合肥復(fù)出相維之意，幸為其左右所阻。繼又曰：“只要我們能消極到底，軍事方面，久持必生變，雖倒河傾海，亦無(wú)能為力?！焙雍Ｔ普?，指河間與東海也。又錚只堅(jiān)持此一策略，以成合肥再造共和之局，合肥亦能動(dòng)心忍性，以增益其所不能。
又錚最重視者，為項(xiàng)城將來(lái)如何收?qǐng)?，合肥又如何出而善后，我們?yōu)槠渥笥艺咧绾晤A(yù)籌也。又錚之中心主張，為佛頭上著不得一點(diǎn)糞。無(wú)論項(xiàng)城以何種名義授合肥，縱使實(shí)際上授以全部軍權(quán)，亦不能接受。一接受，則頭上著糞，永遠(yuǎn)難洗。反之，縱使空虛到委蛇伴食，予以間曹，也當(dāng)拒絕。不拒絕，頭上又著到糞了。故吾人不能輕易授人以口實(shí)。則項(xiàng)城之?dāng)?，敵人不一定能收全功，而我們則操勝算之一半。后來(lái)事實(shí)演變，一如其所料。雖以東海之善于操縱，河間之亟思染指，而北洋軍權(quán)，始終控制于合肥手上者，胥又錚此一堅(jiān)決主張，為奠定其基。
當(dāng)袁氏取消帝制，手令東海，請(qǐng)合肥同籌善后，一切請(qǐng)合肥處理，惟不能再用徐樹(shù)錚。合肥一開(kāi)此言，大怒曰：“事到如今，尚一點(diǎn)不放松。我寧不干，我又如何能干！”
曾氏又云：“大徐最怕小徐，但有時(shí)亦愛(ài)小徐，且想利用小徐，而小徐終其身，只接受其怕，不接受其愛(ài)，更談不到利用。而合肥則不然，能使小徐終其身不見(jiàn)其愛(ài)，只見(jiàn)其信任。不見(jiàn)其怕，更不見(jiàn)其利用。信任矣，愛(ài)何加焉。利用矣，怕必隨之。然則大徐之智出合肥下矣。”
黎元洪就職總統(tǒng)后，任命段祺瑞為國(guó)務(wù)總理，這是段的第三次組閣。段組閣時(shí)有一個(gè)老問(wèn)題，就是要任命徐樹(shù)錚為國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)，黎也是堅(jiān)決不同意的，段把這意思請(qǐng)張國(guó)淦向黎去講，袁死前段亦是請(qǐng)張國(guó)淦向袁要求派徐為秘書長(zhǎng)而被拒。張知道黎也不會(huì)同意，可是又不能不講，才向黎一提，黎就沉下臉來(lái)說(shuō)：“請(qǐng)你告訴總理，一萬(wàn)件事我都依從他，就這一件我辦不到。”張不好把這話對(duì)段講，就去請(qǐng)教徐世昌，徐怕黎、段兩人因此鬧僵，乃親自去見(jiàn)黎說(shuō)：“我以為你一萬(wàn)件事都可以不依從他，這一件非依從他不可，不要怕又錚跋扈，芝泉已經(jīng)夠跋扈的了，多一個(gè)跋扈也差不了多少?！毙焓啦脑捯稽c(diǎn)也沒(méi)有錯(cuò)，在當(dāng)時(shí)的情勢(shì)，段有沒(méi)有徐樹(shù)錚都是一樣，他的眼中根本就沒(méi)有黎元洪。
當(dāng)黎同意徐樹(shù)錚為國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)時(shí)，有一個(gè)保留條件，就是規(guī)定國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)來(lái)見(jiàn)總統(tǒng)陳事時(shí)，須先知會(huì)總統(tǒng)府秘書長(zhǎng)一同入見(jiàn)。這個(gè)規(guī)定也是令人不解的，原來(lái)黎做總統(tǒng)后，段從不以總理身份去見(jiàn)總統(tǒng)，而是由國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)前往。徐樹(shù)錚見(jiàn)黎時(shí)也并不尊敬，黎有時(shí)問(wèn)起某一件公務(wù)時(shí)，他總是這么說(shuō)：“現(xiàn)在是責(zé)任內(nèi)閣制，有總理負(fù)責(zé)，總統(tǒng)不必多問(wèn)?！?br/>
小徐有才氣但任性，段能倚信小徐，實(shí)在很難得，可是小徐的缺點(diǎn)是跋扈，很難與人共事，像張國(guó)淦這樣能夠忍讓的人，亦無(wú)法和小徐相處，竟于8月1日辭職，由丁世嶧繼任。丁鑒于張的失敗，所以采取不讓步態(tài)度對(duì)小徐，并提出府院辦事手續(xù)草案，建議：“大總統(tǒng)得出席閣議發(fā)表意見(jiàn)，但不得參加表決；大總統(tǒng)對(duì)國(guó)務(wù)自由行使其職權(quán)。如用人不同意，得拒絕蓋印。閣員應(yīng)隨時(shí)向總統(tǒng)面商要政，國(guó)務(wù)會(huì)議前須將議事日程陳報(bào)，會(huì)議后須將議事紀(jì)錄呈閱。”
黎自丁世嶧入幕后，聲勢(shì)一振，其左右如哈漢章、金永炎、黎澍、蔣作賓等，亦附和丁的建議。段一怒而請(qǐng)假不視事，賴徐世昌等調(diào)和，段才稍稍讓步，于八月廿六日手諭徐樹(shù)錚：“本院呈請(qǐng)大總統(tǒng)核閱文件，應(yīng)責(zé)成該秘書長(zhǎng)躬自遞呈，用印后赍回，無(wú)論風(fēng)雨黑夜，不得假手他人，以昭慎重而免差異?！庇殖蕡?bào)黎：“逐日文件，均由樹(shù)錚躬遞。該員伉直自愛(ài)，不屑妄語(yǔ)，其于面對(duì)時(shí)，凡有聲明為祺瑞之言者，祺瑞概負(fù)全責(zé)?！睂?duì)有關(guān)府院權(quán)限問(wèn)題，亦議定折衷辦法，即
?。ㄒ唬﹪?guó)務(wù)會(huì)議議事日程先期呈閱，事后送呈議事紀(jì)錄；
（二）國(guó)務(wù)會(huì)議散會(huì)后，推國(guó)務(wù)員一人入府報(bào)告議決事項(xiàng)；
（三）每星期五，國(guó)務(wù)員齊集總統(tǒng)府會(huì)商政務(wù)。舉行聚餐；
（四）總統(tǒng)對(duì)國(guó)務(wù)會(huì)議議決案如有認(rèn)為不合者，得命總理及主管閣員說(shuō)明其理由，如仍認(rèn)為不合，得交復(fù)議一次；
?。ㄎ澹┪唇?jīng)國(guó)務(wù)會(huì)議議決之命令，總統(tǒng)得拒絕蓋印。府院職權(quán)因此明確劃分。
徐樹(shù)錚不只和總統(tǒng)府秘書長(zhǎng)對(duì)立，在國(guó)務(wù)會(huì)議中也引起了極大的麻煩。在第一次閣議中，內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)孫洪伊就和徐樹(shù)錚吵了起來(lái)。照法理講，國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)只能列席內(nèi)閣會(huì)議，并無(wú)發(fā)言權(quán)，那次閣議中，討論到廣東李烈鈞和龍濟(jì)光的糾紛，徐主張電令閩、粵、湘、贛四省會(huì)剿李烈鈞，孫主張去電和解，其他閣員皆贊成孫的主張，不過(guò)為了段的面子，沒(méi)有制止小徐發(fā)言，小徐竟于閣議后，將會(huì)剿李烈鈞的電報(bào)拍發(fā)，待四省復(fù)電國(guó)務(wù)院，閣員們才知其事，孫洪伊遂在閣議席上指責(zé)小徐，小徐也反唇相譏，兩人幾乎拍桌吵鬧，而段卻有左袒小徐的意思。
總統(tǒng)和國(guó)務(wù)院職權(quán)劃分后，國(guó)務(wù)院大權(quán)幾全集中于徐樹(shù)錚之手，不止孫洪伊不滿，其他閣員也不滿意，不久發(fā)生了任命郭宗熙為吉林省長(zhǎng)和查辦福建省長(zhǎng)胡瑞森案，遂使內(nèi)閣的火藥氣氛接近爆炸。這兩案都是徐樹(shù)錚擅行決定，得段同意辦理，既未經(jīng)閣議審查，又沒(méi)有主管內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)副署，徐即以國(guó)務(wù)院名義徑行咨復(fù)國(guó)會(huì)。孫洪伊認(rèn)為小徐眼中完全沒(méi)有內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)，段也不尊重自己，乃當(dāng)面質(zhì)問(wèn)段：凡與各省民政長(zhǎng)及有關(guān)的問(wèn)題，內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)是否無(wú)權(quán)過(guò)問(wèn)？院秘書長(zhǎng)是否有權(quán)擅自處理？段無(wú)言回答，只說(shuō)了一句：“又錚荒唐。”吩咐把胡瑞森一案的咨文追回，可是國(guó)會(huì)已經(jīng)印發(fā)了出去，無(wú)法追回，孫乃于八月三十日憤而辭職。段一面派許世英致意慰留，一面調(diào)整內(nèi)閣辦事程序五點(diǎn)：（一）凡答復(fù)議會(huì)之質(zhì)問(wèn)書，須由主管部起草；（二）頒布命令須由國(guó)務(wù)員副署；（三）院令須經(jīng)國(guó)務(wù)會(huì)議通過(guò)；（四）閣議通過(guò)者，秘書不得擅改；（五）各項(xiàng)法令非經(jīng)總理及主管部總長(zhǎng)副署，不得發(fā)出。黎聞知此事，乃于十月一日召見(jiàn)孫，面予懇留。
不久，孫以裁汰內(nèi)務(wù)部員司，為被汰人員祝書元等28人借口不合文官任免休職條件，控拆于平政院，平政院決定受理，限孫五日內(nèi)提出答復(fù)。孫認(rèn)為平政院是袁所設(shè)，其本身地位有問(wèn)題，因而置之不理。10月7日平政院認(rèn)為內(nèi)務(wù)部非法，任免令一律取消，由院呈請(qǐng)大總統(tǒng)下令執(zhí)行。孫則力斥平政院非法設(shè)立，不在民元《約法》內(nèi)。雙方爭(zhēng)執(zhí)甚為激烈，孫認(rèn)為這是徐樹(shù)錚幕后策劃出來(lái)的。
孫和總統(tǒng)府秘書長(zhǎng)丁世嶧同為國(guó)會(huì)中的韜園系，這一系在國(guó)會(huì)中頗有力量，所以孫亦有恃無(wú)恐，與丁聯(lián)合對(duì)抗小徐。丁對(duì)小徐處處防范抵制，不似張國(guó)淦那么隨和，因此遂使當(dāng)時(shí)政治空氣緊張。
10月18日，徐樹(shù)錚忽然手持“孫洪伊著即免職”的命令請(qǐng)黎蓋印，黎為之駭然，堅(jiān)決不肯蓋印。此后，徐一連到公府催促四次，最后一次公然很不禮貌地說(shuō)：“總統(tǒng)不蓋印，就只能不準(zhǔn)伯蘭（孫）出席國(guó)務(wù)會(huì)議”！此時(shí)，黎一肚子的火大喝一聲：“你說(shuō)的是一句什么話”！徐冷冷地回答說(shuō)：“這是總理說(shuō)的”。
這次政潮的范圍非常之廣。國(guó)會(huì)議員王玉樹(shù)等提出對(duì)政府的質(zhì)問(wèn)案，認(rèn)為要罷免一個(gè)總長(zhǎng)，應(yīng)該由國(guó)會(huì)提出彈劾，而不能準(zhǔn)許國(guó)務(wù)總理獨(dú)斷獨(dú)行。孫洪伊本人則認(rèn)為“國(guó)務(wù)員對(duì)總統(tǒng)應(yīng)負(fù)聯(lián)帶責(zé)任，內(nèi)閣可以總辭，不能單獨(dú)免一個(gè)閣員的職?！?br/>
10月24日，很少到公府來(lái)的段忽然來(lái)到了公府，親自請(qǐng)黎在免孫的命令上蓋印。黎仍然拒絕。段乃氣勢(shì)洶洶地說(shuō)：“總統(tǒng)不肯免孫伯蘭的職，就請(qǐng)免我的職吧”！黎被他這一將軍抵擋不住，便又無(wú)可奈何地說(shuō)：“可以讓伯蘭自動(dòng)辭職，免職令還是不下的好”。但是孫洪伊表示除非總統(tǒng)下令免職，自己決不自動(dòng)辭職。
10月27日，黎請(qǐng)參謀總長(zhǎng)王士珍與孫同到公府來(lái)商量這個(gè)問(wèn)題。王士珍勸孫讓步，以一個(gè)專使的名義出洋考察，不開(kāi)去內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)的職，由次長(zhǎng)代理部務(wù)，以便和緩政潮。孫表示不愿出洋。
國(guó)會(huì)中韜園派議員呂復(fù)、褚輔成等提出了彈劾院秘書長(zhǎng)徐樹(shù)錚案，并且還擬進(jìn)一步彈劾國(guó)務(wù)總理段祺瑞。徐看見(jiàn)問(wèn)題鬧大了，不免情虛膽怯，便表示“只要伯蘭辭去內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)，維持總理的威信，可以調(diào)任為全國(guó)水利總裁，或者外放省長(zhǎng)”。孫表示：“什么官我都不要，只要維持我的人格”。段聽(tīng)了孫不辭職，不出洋，不外調(diào)的話，不禁怒沖沖地說(shuō)：“好，我們大家都辭職，讓孫洪伊一個(gè)人去干”！
一方面表示決不辭職，一方面表示不把他逐出內(nèi)閣就不能維持總理的威信，可是如果維持了總理的威信，勢(shì)必又會(huì)影響到總統(tǒng)的威信，這個(gè)問(wèn)題糾纏不清，始終找不出一個(gè)適當(dāng)?shù)慕鉀Q辦法來(lái)。于是黎的策士主張電召“隱居”衛(wèi)輝的徐世昌到北京組織內(nèi)閣以代段。他們認(rèn)為，段的政治資本是北洋派，而徐世昌在北洋派中的資望遠(yuǎn)在段之上，并且張勛對(duì)徐抱有特殊好感，因此以徐代段不會(huì)引起嚴(yán)重后果。黎也覺(jué)得傀儡總統(tǒng)和蓋印機(jī)器做得太苦了，不如痛痛快快地干一下，就采納了策士們的建議，派王士珍到衛(wèi)輝迎接徐世昌來(lái)。
從10月下旬到11月，徐世昌突然變成“解決時(shí)局的中心人物”。北京傳出來(lái)的消息異常混亂，一會(huì)兒說(shuō)徐即將來(lái)京，一會(huì)兒又說(shuō)他不肯來(lái)。最后，他提出了“擁護(hù)元首”、“維持合肥”、“不入政界三個(gè)條件，要黎答應(yīng)后才肯動(dòng)身。
徐世昌于11月16日到北京，當(dāng)天并不到公府謁見(jiàn)黎。17日，黎親自到五條胡同拜訪他，希望從他取得一些安慰，但是他只向黎說(shuō)了一些海闊天空漫無(wú)邊際的話，黎十分掃興地回到公府來(lái)。府秘書長(zhǎng)丁世嶧勸黎不要因此灰心，他認(rèn)為：“半推半就是人之常情，徐世昌不會(huì)爽爽快快地表示自己愿意做總理。段是個(gè)心地狹小的人，先發(fā)表命令，必然會(huì)負(fù)氣出走，徐就可以從容上臺(tái)了”。黎不以這個(gè)意見(jiàn)為然。另外有人建議電召馮國(guó)璋、陸榮廷晉京，然后下令免段的職，黎也不以為然。那些策士不滿于這種畏首畏尾的態(tài)度，因此，他們沒(méi)有取得黎的同意，就打電報(bào)給馮國(guó)璋，假造“菊老已允出山”的消息，請(qǐng)馮發(fā)電為之捧場(chǎng)。可是馮的消息很靈通，早已知道徐世昌不敢取段而代，同時(shí)馮自己正因?yàn)楫?dāng)選副總統(tǒng)，地位在段之上而感到局促不安，想找一個(gè)機(jī)會(huì)應(yīng)酬段一下，因此回電說(shuō)，內(nèi)閣仍以維持原狀為宜。這樣，就使黎的逐段計(jì)劃多了一層阻力。徐世昌上臺(tái)多了一層顧慮。
17日，徐世昌到府提出府院威信雙方兼顧的辦法，就是孫洪伊、徐樹(shù)錚兩人同時(shí)免職，并且推薦張國(guó)淦繼任院秘書長(zhǎng)。他認(rèn)為張國(guó)淦以前做過(guò)府秘書長(zhǎng)，又做過(guò)段內(nèi)閣的閣員，這樣一個(gè)與雙方都有良好關(guān)系的人繼任秘書長(zhǎng)，一定能夠融洽府院感情。此時(shí)黎既沒(méi)有勇氣拒絕徐世昌的意見(jiàn)，而舍此之外又無(wú)更妥善的辦法，就于20日下令罷免了孫洪伊的內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)。
22日，徐樹(shù)錚拿了免他自己的職的一道命令入府蓋印。黎一面蓋了印，一面又覺(jué)得忐忑不寧，要聘徐做公府軍事顧問(wèn)，還說(shuō)了一些安慰他的好話。
24日，段向公府提出三點(diǎn)質(zhì)問(wèn)：一、現(xiàn)在府方一切措施，是否與責(zé)任內(nèi)閣制的精神完全相符？二、府方經(jīng)常延擱國(guó)務(wù)院的呈閱公文，倘有貽誤，其責(zé)任應(yīng)當(dāng)誰(shuí)屬？三、經(jīng)國(guó)務(wù)會(huì)議通過(guò)應(yīng)當(dāng)發(fā)布的命令，府方經(jīng)常拒絕蓋印，能否說(shuō)明其理由？
孫洪伊仍然退回到國(guó)會(huì)，仍然不斷利用國(guó)會(huì)黨團(tuán)的力量打擊段。6年1月14日，步軍統(tǒng)領(lǐng)江朝宗忽然派兵到羊肉胡同孫宅進(jìn)行搜查，據(jù)說(shuō)孫宅藏有“危險(xiǎn)分子”八人，孫洪伊有“陰蓄死士進(jìn)行暗殺”的嫌疑。這樣，孫便只得逃往南京托庇馮國(guó)璋。
一般人都以為府院政潮已因黎之軟化而告解決，但是段的看法不一樣，他認(rèn)為孫洪伊免職僅僅是內(nèi)閣內(nèi)部的問(wèn)題，不能視為府方的讓步，院秘書長(zhǎng)徐樹(shù)錚既然去職，府秘書長(zhǎng)丁世嶧也該去職。黎本想拒絕段的這個(gè)無(wú)理要求，可是忽然張勛來(lái)一個(gè)痛斥丁世嶧的電報(bào)，因此黎只好同意段的要求，2月25日派夏壽康繼任府秘書長(zhǎng)。
丁世嶧辭秘書長(zhǎng)后，發(fā)表辭職書有云：
“國(guó)務(wù)會(huì)議以前無(wú)議事日程，會(huì)議以后無(wú)報(bào)告，發(fā)一令總統(tǒng)不知其用意，任一官總統(tǒng)不知其來(lái)歷，國(guó)務(wù)總理恒匝旬不一晤總統(tǒng)，惟見(jiàn)秘書長(zhǎng)傳達(dá)于其間，有所詢則以事經(jīng)閣議，內(nèi)閣負(fù)責(zé)為對(duì)抗。大總統(tǒng)無(wú)見(jiàn)無(wú)聞，日以坐待用印為盡職。……曹汝霖使日事，一月以前日外務(wù)省早經(jīng)奏明日皇，而我大總統(tǒng)至?xí)r尚未盡知其事。內(nèi)閣與章公使往來(lái)十余電報(bào)未一呈閱。
……”
北洋時(shí)代有大徐小徐，大段小段，所謂大徐是徐世昌，小徐就指徐樹(shù)錚，大段是段祺瑞，小段是指段芝貴。
小徐如何影響段祺瑞，如何操縱運(yùn)用，可自一則筆記中看出，這是段的另一智囊曾毓雋所敘袁世凱稱帝時(shí)和段祺瑞鬧僵的一幕，曾毓雋因?yàn)槭嵌紊磉吽H信的人物，他的描敘自然很近事實(shí)：
?。ㄔ闺h言：）項(xiàng)城蓄謀帝制之始，合肥微窺其隱，即召余（曾自稱）及又錚諸人秘商曰：“項(xiàng)城帝制自為之跡，已漸顯露。我當(dāng)年曾采取共和之電，如今又擁項(xiàng)城登基把認(rèn)識(shí)限制在感覺(jué)的范圍內(nèi)。還力圖超越主客觀的對(duì)立、把，國(guó)人其謂我何？且恐二十四史中，亦再找不出此等人物！所以論公，我寧死亦不參與，論私，我從此只有退休，決不多發(fā)一言”。
后來(lái)帝制形成，合肥養(yǎng)病京郊。一夕，項(xiàng)城忽召余曰：“松坡已離京轉(zhuǎn)滇，芝泉亦知之乎？為我轉(zhuǎn)告芝泉，此時(shí)忍坐視我滿頭白發(fā)，遭人摧毀欺負(fù)耶？”繼又忿然曰：“沒(méi)有我，恐怕也沒(méi)有你們！我今年逾五十，位極元首，個(gè)人尚有何求？然不能不為此一團(tuán)體打算，我們不能讓人家打到大門口來(lái)！即有錯(cuò)誤，第一個(gè)了解我，又能諒解我的，應(yīng)該是芝泉。今乃剛剛相反，芝泉竟是第一個(gè)不了解我，不諒解我的。實(shí)令人不解！汝可轉(zhuǎn)告他”。
繼又曰：“最好芝泉能親自來(lái)見(jiàn)我”。于是提筆草就一函。交余遞段。段閱后決定仍不往見(jiàn)，囑余擬稿，加以矯正，交余面呈項(xiàng)城。于是我又往謁項(xiàng)城，作第二次之密談。袁拆函一瞥，隨命余曰：“汝且退，明日此時(shí)，可再來(lái)此”。
余謁段報(bào)告見(jiàn)袁經(jīng)過(guò)，段曰：“汝明日復(fù)謁項(xiàng)城，不必多費(fèi)一詞，只聽(tīng)其發(fā)付可也。生死且不計(jì)，何有于得失！”
余歸，竟夕不能成寐，想找又錚諸人一商，則又錚實(shí)為與合肥同一鼻孔出氣之人。且合肥此種堅(jiān)決態(tài)度，十之七八受又錚影響為多。乃作罷。
余謁合肥，請(qǐng)其在可能范圍內(nèi)予以便宜行事。段鄭重聲明曰：“除不擁護(hù)項(xiàng)城做皇帝，及暫不謁見(jiàn)外，其他均可便宜行事?！庇殖邢喔嬖唬骸白蛲碛皱P來(lái)稱：項(xiàng)城左右，已亟謀不利于我，并及又錚。聞他們只待上面點(diǎn)頭，便采取行動(dòng)。我料此乃想當(dāng)然事，但亦不可不防范之?！?br/>
我離合肥處后，頗有歧路徘徊之感。繼思又錚畢竟權(quán)奇倜儻人也，不如試一探詢其本意，然后請(qǐng)其相助。因逕往某俱樂(lè)部見(jiàn)又錚，坦白告以一切經(jīng)過(guò)。又錚笑曰：“閣下誠(chéng)坦白，但尚隱有一事，即項(xiàng)城大罵徐樹(shù)錚該死是也。”余亦笑曰：“事誠(chéng)有之，何必贅述，以攖君之怒。”我乃更告以項(xiàng)城與合肥各執(zhí)一端，無(wú)法向項(xiàng)城復(fù)命之苦，請(qǐng)智多星為我設(shè)想。又錚先說(shuō)笑……見(jiàn)余若有不豫色然者，始正經(jīng)為計(jì)曰：“閣下明日仍先謁項(xiàng)城，告以合肥擬俟稍愈，即親謁面呈密要。項(xiàng)城能得與合肥面談，必喜且不勝，然后吾人徐圖補(bǔ)救。茲事體大，不可造次。”余覺(jué)又錚所言極是，次日再謁項(xiàng)城?！?br/>
此次謁項(xiàng)城為第三度。見(jiàn)袁后即告曰：“段以茲事體大，決俟病體稍愈，躬親請(qǐng)謁，而呈一切?！庇止室饧又卣Z(yǔ)氣，重說(shuō)曰：“親來(lái)密商，比較方便。覺(jué)其病狀已好轉(zhuǎn)，大約最短期內(nèi)即可應(yīng)命前來(lái)?！表?xiàng)城聽(tīng)到最短期內(nèi)可以會(huì)晤，立刻變?yōu)橄矏?。我正想乘機(jī)告退，但項(xiàng)城準(zhǔn)備發(fā)言了。他一發(fā)問(wèn)，問(wèn)題便多。我暗中在咎又錚：凡所作計(jì)，總帶幾分冒險(xiǎn)性質(zhì)。正在冥想，見(jiàn)項(xiàng)城檢交馮華甫親筆函曰，汝試一閱，必覺(jué)其真有進(jìn)步。我讀后，記函中警句云：“京以外事，倘有所命，決不敢辭。惟京內(nèi)事，則極望菊人、芝泉諸兄能切實(shí)秉命而行，不要為其左右所誤?！贝艘徽Z(yǔ)明明系指合肥之信任又錚，最中項(xiàng)城之忌。我不待項(xiàng)城發(fā)言，即批評(píng)該函云：“無(wú)論東海、河間、合肥，皆屬國(guó)家柱石，似應(yīng)同心協(xié)力，三位一體。……如相互猜忌，則恐禍起蕭墻，非國(guó)家之福。”項(xiàng)城云：可為我將華甫此意，轉(zhuǎn)告芝泉。旋又急曰：“且慢，又錚其人，亦小有才，如循正軌，可期遠(yuǎn)到。但傲岸自是，開(kāi)罪于人特多。芝泉如愛(ài)之，不應(yīng)反以害之?！嗫蔀槲肄D(zhuǎn)加勉勵(lì)，并可將去此函共閱。”
余自公府辭出后，即見(jiàn)合肥，告以已代為權(quán)允病愈后往謁面談。并遞上河間致項(xiàng)城手函。合肥看罷，即擲之于地曰：
“馮華甫本來(lái)是狗，現(xiàn)在看來(lái)，簡(jiǎn)直連狗不如！”
我說(shuō)既已權(quán)允病愈往見(jiàn)，則不能稱病到底，事先應(yīng)有準(zhǔn)備才好。合肥曰：“又錚來(lái)過(guò)，亦為此事?lián)?，汝可找又錚共商?！?br/>
我找到又錚，出示馮函，又錚曰：“我們還是抓定自己的原則，即第一：不論直接間接，積極消極，均反對(duì)帝制到底。第二：欲項(xiàng)城中途取消稱帝野心，據(jù)張季老相告，已完全失望。所以合肥還是始終稱病不見(jiàn)為上?！蔽曳瘩g曰：“不見(jiàn)固佳，但不能稱病到底。”又錚思之有頃，忽拍案叫曰：“得矣，我可派人揚(yáng)言于梁燕孫、楊皙子輩：‘只要合肥愿見(jiàn)項(xiàng)城，項(xiàng)城可答允合肥一切要求，所謂要求，包括人事調(diào)整’云云。彼輩一聞此言，恐被指名調(diào)整，必多方設(shè)法以緩項(xiàng)城與合肥之見(jiàn)面，則吾人可從容坐視其變?！?br/>
余每暗服徐之勇邁而兼有雅量。因一再相約曰：“一切如君所論，但請(qǐng)從速進(jìn)行。”
果然，此后多日，項(xiàng)城不再召我，又錚之謀告成矣。
忽一夕梁燕孫過(guò)訪……曰：“頃間項(xiàng)城相告，謂據(jù)足下轉(zhuǎn)陳，合肥已允病愈往謁。果能如此，何事不可商量。第一，馮華甫即不敢再如目前之作壁上觀，而將一切責(zé)任推諸合肥身上。第二，東南西南各省督使，對(duì)我方必立刻改變觀念，而有所顧慮，以共尋求緩沖之道。則項(xiàng)城做不做皇帝，均得有時(shí)間從長(zhǎng)計(jì)議?！蔽掖鹪唬骸昂戏室褯Q定病愈往謁，但項(xiàng)城左右，恐非每個(gè)人都如閣下想法。……合肥個(gè)性，閣下所知，決不可供群小玩弄?！绷菏显疲骸白阆轮允且?，容將此意往陳項(xiàng)城，得其了解，再來(lái)就商?！?br/>
梁去后，余即往告又錚，徐曰：“有我徐某在，決不令此獠猖獗禍國(guó)也?！?br/>
我問(wèn)曰：“君謂南皮項(xiàng)城，是半豪杰，作何解？”徐曰：“南皮一生，以罵人起家。項(xiàng)城一生，以騙人起家。非豪杰不敢以罵人，非豪杰不足以騙人。然真豪杰，則既不罵人，更不騙人。今南皮與項(xiàng)城一罵人，一騙人，吾故曰半豪杰也。豪杰而曰半者，其他一半，屬屠沽故也。”徐氏述畢，關(guān)于梁燕孫與我晤談之應(yīng)付，又錚毅然曰：“我料梁氏旨在窺探吾人意向，暫時(shí)決不會(huì)慫恿項(xiàng)城召見(jiàn)閣下。因我所做工夫重點(diǎn)，即在投彼輩所好，可使項(xiàng)城一時(shí)更不圖見(jiàn)合肥，請(qǐng)君高枕看我好謀?！蔽疑钚庞皱P之能，遂亦置之。
項(xiàng)城欲與合肥見(jiàn)面，終因又錚窺破項(xiàng)城左右意圖，略施拖延小計(jì)。不久蔡松坡云南起義，項(xiàng)城亦勢(shì)成騎虎，不能登其大寶。
某夕。又錚過(guò)訪，謂項(xiàng)城又有請(qǐng)合肥復(fù)出相維之意，幸為其左右所阻。繼又曰：“只要我們能消極到底，軍事方面，久持必生變，雖倒河傾海，亦無(wú)能為力?！焙雍Ｔ普?，指河間與東海也。又錚只堅(jiān)持此一策略，以成合肥再造共和之局，合肥亦能動(dòng)心忍性，以增益其所不能。
又錚最重視者，為項(xiàng)城將來(lái)如何收?qǐng)?，合肥又如何出而善后，我們?yōu)槠渥笥艺咧绾晤A(yù)籌也。又錚之中心主張，為佛頭上著不得一點(diǎn)糞。無(wú)論項(xiàng)城以何種名義授合肥，縱使實(shí)際上授以全部軍權(quán)，亦不能接受。一接受，則頭上著糞，永遠(yuǎn)難洗。反之，縱使空虛到委蛇伴食，予以間曹，也當(dāng)拒絕。不拒絕，頭上又著到糞了。故吾人不能輕易授人以口實(shí)。則項(xiàng)城之?dāng)?，敵人不一定能收全功，而我們則操勝算之一半。后來(lái)事實(shí)演變，一如其所料。雖以東海之善于操縱，河間之亟思染指，而北洋軍權(quán)，始終控制于合肥手上者，胥又錚此一堅(jiān)決主張，為奠定其基。
當(dāng)袁氏取消帝制，手令東海，請(qǐng)合肥同籌善后，一切請(qǐng)合肥處理，惟不能再用徐樹(shù)錚。合肥一開(kāi)此言，大怒曰：“事到如今，尚一點(diǎn)不放松。我寧不干，我又如何能干！”
曾氏又云：“大徐最怕小徐，但有時(shí)亦愛(ài)小徐，且想利用小徐，而小徐終其身，只接受其怕，不接受其愛(ài)，更談不到利用。而合肥則不然，能使小徐終其身不見(jiàn)其愛(ài)，只見(jiàn)其信任。不見(jiàn)其怕，更不見(jiàn)其利用。信任矣，愛(ài)何加焉。利用矣，怕必隨之。然則大徐之智出合肥下矣。”
黎元洪就職總統(tǒng)后，任命段祺瑞為國(guó)務(wù)總理，這是段的第三次組閣。段組閣時(shí)有一個(gè)老問(wèn)題，就是要任命徐樹(shù)錚為國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)，黎也是堅(jiān)決不同意的，段把這意思請(qǐng)張國(guó)淦向黎去講，袁死前段亦是請(qǐng)張國(guó)淦向袁要求派徐為秘書長(zhǎng)而被拒。張知道黎也不會(huì)同意，可是又不能不講，才向黎一提，黎就沉下臉來(lái)說(shuō)：“請(qǐng)你告訴總理，一萬(wàn)件事我都依從他，就這一件我辦不到。”張不好把這話對(duì)段講，就去請(qǐng)教徐世昌，徐怕黎、段兩人因此鬧僵，乃親自去見(jiàn)黎說(shuō)：“我以為你一萬(wàn)件事都可以不依從他，這一件非依從他不可，不要怕又錚跋扈，芝泉已經(jīng)夠跋扈的了，多一個(gè)跋扈也差不了多少?！毙焓啦脑捯稽c(diǎn)也沒(méi)有錯(cuò)，在當(dāng)時(shí)的情勢(shì)，段有沒(méi)有徐樹(shù)錚都是一樣，他的眼中根本就沒(méi)有黎元洪。
當(dāng)黎同意徐樹(shù)錚為國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)時(shí)，有一個(gè)保留條件，就是規(guī)定國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)來(lái)見(jiàn)總統(tǒng)陳事時(shí)，須先知會(huì)總統(tǒng)府秘書長(zhǎng)一同入見(jiàn)。這個(gè)規(guī)定也是令人不解的，原來(lái)黎做總統(tǒng)后，段從不以總理身份去見(jiàn)總統(tǒng)，而是由國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)前往。徐樹(shù)錚見(jiàn)黎時(shí)也并不尊敬，黎有時(shí)問(wèn)起某一件公務(wù)時(shí)，他總是這么說(shuō)：“現(xiàn)在是責(zé)任內(nèi)閣制，有總理負(fù)責(zé)，總統(tǒng)不必多問(wèn)?！?br/>
小徐有才氣但任性，段能倚信小徐，實(shí)在很難得，可是小徐的缺點(diǎn)是跋扈，很難與人共事，像張國(guó)淦這樣能夠忍讓的人，亦無(wú)法和小徐相處，竟于8月1日辭職，由丁世嶧繼任。丁鑒于張的失敗，所以采取不讓步態(tài)度對(duì)小徐，并提出府院辦事手續(xù)草案，建議：“大總統(tǒng)得出席閣議發(fā)表意見(jiàn)，但不得參加表決；大總統(tǒng)對(duì)國(guó)務(wù)自由行使其職權(quán)。如用人不同意，得拒絕蓋印。閣員應(yīng)隨時(shí)向總統(tǒng)面商要政，國(guó)務(wù)會(huì)議前須將議事日程陳報(bào)，會(huì)議后須將議事紀(jì)錄呈閱。”
黎自丁世嶧入幕后，聲勢(shì)一振，其左右如哈漢章、金永炎、黎澍、蔣作賓等，亦附和丁的建議。段一怒而請(qǐng)假不視事，賴徐世昌等調(diào)和，段才稍稍讓步，于八月廿六日手諭徐樹(shù)錚：“本院呈請(qǐng)大總統(tǒng)核閱文件，應(yīng)責(zé)成該秘書長(zhǎng)躬自遞呈，用印后赍回，無(wú)論風(fēng)雨黑夜，不得假手他人，以昭慎重而免差異?！庇殖蕡?bào)黎：“逐日文件，均由樹(shù)錚躬遞。該員伉直自愛(ài)，不屑妄語(yǔ)，其于面對(duì)時(shí)，凡有聲明為祺瑞之言者，祺瑞概負(fù)全責(zé)?！睂?duì)有關(guān)府院權(quán)限問(wèn)題，亦議定折衷辦法，即
?。ㄒ唬﹪?guó)務(wù)會(huì)議議事日程先期呈閱，事后送呈議事紀(jì)錄；
（二）國(guó)務(wù)會(huì)議散會(huì)后，推國(guó)務(wù)員一人入府報(bào)告議決事項(xiàng)；
（三）每星期五，國(guó)務(wù)員齊集總統(tǒng)府會(huì)商政務(wù)。舉行聚餐；
（四）總統(tǒng)對(duì)國(guó)務(wù)會(huì)議議決案如有認(rèn)為不合者，得命總理及主管閣員說(shuō)明其理由，如仍認(rèn)為不合，得交復(fù)議一次；
?。ㄎ澹┪唇?jīng)國(guó)務(wù)會(huì)議議決之命令，總統(tǒng)得拒絕蓋印。府院職權(quán)因此明確劃分。
徐樹(shù)錚不只和總統(tǒng)府秘書長(zhǎng)對(duì)立，在國(guó)務(wù)會(huì)議中也引起了極大的麻煩。在第一次閣議中，內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)孫洪伊就和徐樹(shù)錚吵了起來(lái)。照法理講，國(guó)務(wù)院秘書長(zhǎng)只能列席內(nèi)閣會(huì)議，并無(wú)發(fā)言權(quán)，那次閣議中，討論到廣東李烈鈞和龍濟(jì)光的糾紛，徐主張電令閩、粵、湘、贛四省會(huì)剿李烈鈞，孫主張去電和解，其他閣員皆贊成孫的主張，不過(guò)為了段的面子，沒(méi)有制止小徐發(fā)言，小徐竟于閣議后，將會(huì)剿李烈鈞的電報(bào)拍發(fā)，待四省復(fù)電國(guó)務(wù)院，閣員們才知其事，孫洪伊遂在閣議席上指責(zé)小徐，小徐也反唇相譏，兩人幾乎拍桌吵鬧，而段卻有左袒小徐的意思。
總統(tǒng)和國(guó)務(wù)院職權(quán)劃分后，國(guó)務(wù)院大權(quán)幾全集中于徐樹(shù)錚之手，不止孫洪伊不滿，其他閣員也不滿意，不久發(fā)生了任命郭宗熙為吉林省長(zhǎng)和查辦福建省長(zhǎng)胡瑞森案，遂使內(nèi)閣的火藥氣氛接近爆炸。這兩案都是徐樹(shù)錚擅行決定，得段同意辦理，既未經(jīng)閣議審查，又沒(méi)有主管內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)副署，徐即以國(guó)務(wù)院名義徑行咨復(fù)國(guó)會(huì)。孫洪伊認(rèn)為小徐眼中完全沒(méi)有內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)，段也不尊重自己，乃當(dāng)面質(zhì)問(wèn)段：凡與各省民政長(zhǎng)及有關(guān)的問(wèn)題，內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)是否無(wú)權(quán)過(guò)問(wèn)？院秘書長(zhǎng)是否有權(quán)擅自處理？段無(wú)言回答，只說(shuō)了一句：“又錚荒唐。”吩咐把胡瑞森一案的咨文追回，可是國(guó)會(huì)已經(jīng)印發(fā)了出去，無(wú)法追回，孫乃于八月三十日憤而辭職。段一面派許世英致意慰留，一面調(diào)整內(nèi)閣辦事程序五點(diǎn)：（一）凡答復(fù)議會(huì)之質(zhì)問(wèn)書，須由主管部起草；（二）頒布命令須由國(guó)務(wù)員副署；（三）院令須經(jīng)國(guó)務(wù)會(huì)議通過(guò)；（四）閣議通過(guò)者，秘書不得擅改；（五）各項(xiàng)法令非經(jīng)總理及主管部總長(zhǎng)副署，不得發(fā)出。黎聞知此事，乃于十月一日召見(jiàn)孫，面予懇留。
不久，孫以裁汰內(nèi)務(wù)部員司，為被汰人員祝書元等28人借口不合文官任免休職條件，控拆于平政院，平政院決定受理，限孫五日內(nèi)提出答復(fù)。孫認(rèn)為平政院是袁所設(shè)，其本身地位有問(wèn)題，因而置之不理。10月7日平政院認(rèn)為內(nèi)務(wù)部非法，任免令一律取消，由院呈請(qǐng)大總統(tǒng)下令執(zhí)行。孫則力斥平政院非法設(shè)立，不在民元《約法》內(nèi)。雙方爭(zhēng)執(zhí)甚為激烈，孫認(rèn)為這是徐樹(shù)錚幕后策劃出來(lái)的。
孫和總統(tǒng)府秘書長(zhǎng)丁世嶧同為國(guó)會(huì)中的韜園系，這一系在國(guó)會(huì)中頗有力量，所以孫亦有恃無(wú)恐，與丁聯(lián)合對(duì)抗小徐。丁對(duì)小徐處處防范抵制，不似張國(guó)淦那么隨和，因此遂使當(dāng)時(shí)政治空氣緊張。
10月18日，徐樹(shù)錚忽然手持“孫洪伊著即免職”的命令請(qǐng)黎蓋印，黎為之駭然，堅(jiān)決不肯蓋印。此后，徐一連到公府催促四次，最后一次公然很不禮貌地說(shuō)：“總統(tǒng)不蓋印，就只能不準(zhǔn)伯蘭（孫）出席國(guó)務(wù)會(huì)議”！此時(shí)，黎一肚子的火大喝一聲：“你說(shuō)的是一句什么話”！徐冷冷地回答說(shuō)：“這是總理說(shuō)的”。
這次政潮的范圍非常之廣。國(guó)會(huì)議員王玉樹(shù)等提出對(duì)政府的質(zhì)問(wèn)案，認(rèn)為要罷免一個(gè)總長(zhǎng)，應(yīng)該由國(guó)會(huì)提出彈劾，而不能準(zhǔn)許國(guó)務(wù)總理獨(dú)斷獨(dú)行。孫洪伊本人則認(rèn)為“國(guó)務(wù)員對(duì)總統(tǒng)應(yīng)負(fù)聯(lián)帶責(zé)任，內(nèi)閣可以總辭，不能單獨(dú)免一個(gè)閣員的職?！?br/>
10月24日，很少到公府來(lái)的段忽然來(lái)到了公府，親自請(qǐng)黎在免孫的命令上蓋印。黎仍然拒絕。段乃氣勢(shì)洶洶地說(shuō)：“總統(tǒng)不肯免孫伯蘭的職，就請(qǐng)免我的職吧”！黎被他這一將軍抵擋不住，便又無(wú)可奈何地說(shuō)：“可以讓伯蘭自動(dòng)辭職，免職令還是不下的好”。但是孫洪伊表示除非總統(tǒng)下令免職，自己決不自動(dòng)辭職。
10月27日，黎請(qǐng)參謀總長(zhǎng)王士珍與孫同到公府來(lái)商量這個(gè)問(wèn)題。王士珍勸孫讓步，以一個(gè)專使的名義出洋考察，不開(kāi)去內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)的職，由次長(zhǎng)代理部務(wù)，以便和緩政潮。孫表示不愿出洋。
國(guó)會(huì)中韜園派議員呂復(fù)、褚輔成等提出了彈劾院秘書長(zhǎng)徐樹(shù)錚案，并且還擬進(jìn)一步彈劾國(guó)務(wù)總理段祺瑞。徐看見(jiàn)問(wèn)題鬧大了，不免情虛膽怯，便表示“只要伯蘭辭去內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)，維持總理的威信，可以調(diào)任為全國(guó)水利總裁，或者外放省長(zhǎng)”。孫表示：“什么官我都不要，只要維持我的人格”。段聽(tīng)了孫不辭職，不出洋，不外調(diào)的話，不禁怒沖沖地說(shuō)：“好，我們大家都辭職，讓孫洪伊一個(gè)人去干”！
一方面表示決不辭職，一方面表示不把他逐出內(nèi)閣就不能維持總理的威信，可是如果維持了總理的威信，勢(shì)必又會(huì)影響到總統(tǒng)的威信，這個(gè)問(wèn)題糾纏不清，始終找不出一個(gè)適當(dāng)?shù)慕鉀Q辦法來(lái)。于是黎的策士主張電召“隱居”衛(wèi)輝的徐世昌到北京組織內(nèi)閣以代段。他們認(rèn)為，段的政治資本是北洋派，而徐世昌在北洋派中的資望遠(yuǎn)在段之上，并且張勛對(duì)徐抱有特殊好感，因此以徐代段不會(huì)引起嚴(yán)重后果。黎也覺(jué)得傀儡總統(tǒng)和蓋印機(jī)器做得太苦了，不如痛痛快快地干一下，就采納了策士們的建議，派王士珍到衛(wèi)輝迎接徐世昌來(lái)。
從10月下旬到11月，徐世昌突然變成“解決時(shí)局的中心人物”。北京傳出來(lái)的消息異常混亂，一會(huì)兒說(shuō)徐即將來(lái)京，一會(huì)兒又說(shuō)他不肯來(lái)。最后，他提出了“擁護(hù)元首”、“維持合肥”、“不入政界三個(gè)條件，要黎答應(yīng)后才肯動(dòng)身。
徐世昌于11月16日到北京，當(dāng)天并不到公府謁見(jiàn)黎。17日，黎親自到五條胡同拜訪他，希望從他取得一些安慰，但是他只向黎說(shuō)了一些海闊天空漫無(wú)邊際的話，黎十分掃興地回到公府來(lái)。府秘書長(zhǎng)丁世嶧勸黎不要因此灰心，他認(rèn)為：“半推半就是人之常情，徐世昌不會(huì)爽爽快快地表示自己愿意做總理。段是個(gè)心地狹小的人，先發(fā)表命令，必然會(huì)負(fù)氣出走，徐就可以從容上臺(tái)了”。黎不以這個(gè)意見(jiàn)為然。另外有人建議電召馮國(guó)璋、陸榮廷晉京，然后下令免段的職，黎也不以為然。那些策士不滿于這種畏首畏尾的態(tài)度，因此，他們沒(méi)有取得黎的同意，就打電報(bào)給馮國(guó)璋，假造“菊老已允出山”的消息，請(qǐng)馮發(fā)電為之捧場(chǎng)。可是馮的消息很靈通，早已知道徐世昌不敢取段而代，同時(shí)馮自己正因?yàn)楫?dāng)選副總統(tǒng)，地位在段之上而感到局促不安，想找一個(gè)機(jī)會(huì)應(yīng)酬段一下，因此回電說(shuō)，內(nèi)閣仍以維持原狀為宜。這樣，就使黎的逐段計(jì)劃多了一層阻力。徐世昌上臺(tái)多了一層顧慮。
17日，徐世昌到府提出府院威信雙方兼顧的辦法，就是孫洪伊、徐樹(shù)錚兩人同時(shí)免職，并且推薦張國(guó)淦繼任院秘書長(zhǎng)。他認(rèn)為張國(guó)淦以前做過(guò)府秘書長(zhǎng)，又做過(guò)段內(nèi)閣的閣員，這樣一個(gè)與雙方都有良好關(guān)系的人繼任秘書長(zhǎng)，一定能夠融洽府院感情。此時(shí)黎既沒(méi)有勇氣拒絕徐世昌的意見(jiàn)，而舍此之外又無(wú)更妥善的辦法，就于20日下令罷免了孫洪伊的內(nèi)務(wù)總長(zhǎng)。
22日，徐樹(shù)錚拿了免他自己的職的一道命令入府蓋印。黎一面蓋了印，一面又覺(jué)得忐忑不寧，要聘徐做公府軍事顧問(wèn)，還說(shuō)了一些安慰他的好話。
24日，段向公府提出三點(diǎn)質(zhì)問(wèn)：一、現(xiàn)在府方一切措施，是否與責(zé)任內(nèi)閣制的精神完全相符？二、府方經(jīng)常延擱國(guó)務(wù)院的呈閱公文，倘有貽誤，其責(zé)任應(yīng)當(dāng)誰(shuí)屬？三、經(jīng)國(guó)務(wù)會(huì)議通過(guò)應(yīng)當(dāng)發(fā)布的命令，府方經(jīng)常拒絕蓋印，能否說(shuō)明其理由？
孫洪伊仍然退回到國(guó)會(huì)，仍然不斷利用國(guó)會(huì)黨團(tuán)的力量打擊段。6年1月14日，步軍統(tǒng)領(lǐng)江朝宗忽然派兵到羊肉胡同孫宅進(jìn)行搜查，據(jù)說(shuō)孫宅藏有“危險(xiǎn)分子”八人，孫洪伊有“陰蓄死士進(jìn)行暗殺”的嫌疑。這樣，孫便只得逃往南京托庇馮國(guó)璋。
一般人都以為府院政潮已因黎之軟化而告解決，但是段的看法不一樣，他認(rèn)為孫洪伊免職僅僅是內(nèi)閣內(nèi)部的問(wèn)題，不能視為府方的讓步，院秘書長(zhǎng)徐樹(shù)錚既然去職，府秘書長(zhǎng)丁世嶧也該去職。黎本想拒絕段的這個(gè)無(wú)理要求，可是忽然張勛來(lái)一個(gè)痛斥丁世嶧的電報(bào)，因此黎只好同意段的要求，2月25日派夏壽康繼任府秘書長(zhǎng)。
丁世嶧辭秘書長(zhǎng)后，發(fā)表辭職書有云：
“國(guó)務(wù)會(huì)議以前無(wú)議事日程，會(huì)議以后無(wú)報(bào)告，發(fā)一令總統(tǒng)不知其用意，任一官總統(tǒng)不知其來(lái)歷，國(guó)務(wù)總理恒匝旬不一晤總統(tǒng)，惟見(jiàn)秘書長(zhǎng)傳達(dá)于其間，有所詢則以事經(jīng)閣議，內(nèi)閣負(fù)責(zé)為對(duì)抗。大總統(tǒng)無(wú)見(jiàn)無(wú)聞，日以坐待用印為盡職。……曹汝霖使日事，一月以前日外務(wù)省早經(jīng)奏明日皇，而我大總統(tǒng)至?xí)r尚未盡知其事。內(nèi)閣與章公使往來(lái)十余電報(bào)未一呈閱。
……”
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