最后，根據(jù)希特勒的第46號訓令，在蘇聯(lián)占領區(qū)的所有德國非軍事人員，包括帝國青年義務勞動隊，鐵路職工，農(nóng)林人員等等，也要配備精良武器，加入清剿行動。希特勒規(guī)定，“在受游擊隊威脅的地區(qū)，不允許有消極或被動參加同游擊隊斗爭的德國人”。根據(jù)蘇聯(lián)方面的統(tǒng)計，到1943年，用于對付蘇聯(lián)游擊隊的德軍輔助人員，總數(shù)約50萬人。這個數(shù)字并沒有得到更可靠來源的證實。但根據(jù)希特勒的指示，大量德國非軍事人員也必須參與清剿。

德國正規(guī)軍后方部隊和后備部隊、德國警察和形形色色的仆從輔助人員，組成了龐大的東線占領力量。依據(jù)所在地區(qū)的不同（而非完全的隸屬關(guān)系），這些占領部隊，有的聽命于德國軍隊，有的聽命于德國后方占領機構(gòu)，并不斷發(fā)動清剿。但蘇聯(lián)游擊隊非但沒有被消滅，反而有愈演愈烈之勢。地處白俄羅斯和俄羅斯一部分地區(qū)的中央集團軍群后方，由于當?shù)鼐用竦拿褡鍖傩愿欣谟螕絷牭幕顒樱瑢е略摷瘓F軍群面臨的形勢尤其嚴峻，其后方地域司令部1943年5月9日就報告稱，僅靠現(xiàn)有的59個警衛(wèi)或者警察營，根本無法保證漫長的交通線免遭游擊隊的侵襲。德軍為庫爾斯克戰(zhàn)役進行的后勤準備，因此受到了直接影響。

為了徹底消除蘇聯(lián)游擊隊的威脅，給即將到來的東線夏季會戰(zhàn)創(chuàng)造一個穩(wěn)固的后方，德國人決定利用前線平靜的有利時機，將一些野戰(zhàn)部隊暫時撤下來，加強反游擊戰(zhàn)的力量。這樣，連同原有的警衛(wèi)師在內(nèi)，德國正規(guī)軍用來對付游擊隊的兵力增加到了25個師。

5月，中央集團軍群大規(guī)模反游擊行動拉開了序幕，清剿的重點是布良斯克西南部。德軍第2裝甲集團軍第47裝甲軍、第55軍，第3裝甲集團軍和第4集團軍，實施了代號“吉普賽男爵”、“魔彈射手”、“五月雷暴”和“友鄰支援1、2”的行動。投入的部隊，除了2個警衛(wèi)師，大量后方警衛(wèi)警察部隊外，還包括從匈牙利步兵第102師，德國步兵第6、7、292、102、707師，第4、5、18裝甲師、第10摩托化師等眾多野戰(zhàn)兵團抽調(diào)來的兵員，其中包括坦克分隊。在布良斯克地區(qū)，投入兵力約4萬人，在明斯克地區(qū)，投入3萬人。連同其他地區(qū)投入的兵力，中央集團軍群動員的人員可能在10萬左右，并且得到飛機火炮，坦克和自行火炮的配合。

對這次大規(guī)模的東線反游擊行動，無論是前蘇聯(lián)史料還是西方史料都介紹得不多。德方宣布的戰(zhàn)果為擊斃3152名游擊隊員，俘虜569人。但行動本身的結(jié)果并不理想。參與圍剿的匈牙利軍隊在戰(zhàn)后總結(jié)中承認，動用大兵團清剿游擊隊的效果不明顯。匈軍在戰(zhàn)斗中付出了戰(zhàn)死800人的代價。清剿行動在6月份結(jié)束。就在這個月，德國的統(tǒng)計卻顯示，蘇聯(lián)游擊隊襲擊鐵路設施仍然高達1092次，摧毀或破壞機車409輛，可見清剿效果的微弱。而根據(jù)蘇方統(tǒng)計，在4-7月，游擊隊一共炸毀德軍列車1700列。

面對蘇聯(lián)游擊運動的膨脹，以羅森堡為首的一些納粹官員開始勸說希特勒改善在蘇聯(lián)的占領政策，更多以胡蘿卜取代大棒，并爭取當?shù)氐拿褡逯髁x勢力。但希特勒和強硬派的占領區(qū)官員則認為，對蘇聯(lián)占領區(qū)采取懷柔政策，不僅不利于掠奪當?shù)氐奈镔Y和勞動力，輕率扶植當?shù)孛褡逯髁x的做法，還會為未來帶來巨大的麻煩。蘇聯(lián)對西烏克蘭懷柔的失敗已經(jīng)證實了這一點。

靠極端民族主義上臺的希特勒本人很清楚民族主義所蘊藏的巨大力量，更了解其多變和不可控制：他們固然不會輕易屈服于大棒，但更不會隨便就被幾根蘿卜收買，反而會在蘿卜的滋養(yǎng)下膨脹起來。在某些自以為是的政治家，為了眼前的一點利益而隨意扶植勢力的同時，或許已經(jīng)為自己的未來挖掘了墳墓。

隨著7月和庫爾斯克會戰(zhàn)的臨近，德國軍隊的后方形勢并沒有多大改善，只能將游擊隊的活動控制在一個可以維持的程度上。不過希特勒明白改善后方形勢的根本途徑。他本人說過：“只有在城堡行動中獲勝，我們才能消除盟友的失望情緒，熄滅被我們征服人民的希望”。