由于第一次合同中有些問題沒有列入，中美在1944年秋天又補充簽訂了第二次合同。除了正式規(guī)定美國為軍統(tǒng)訓練新式特務分子及供應有關器材外，并答應由軍統(tǒng)選派大特務40名分兩批赴美留學，為軍統(tǒng)培養(yǎng)出一批高級骨干分子。除來往旅費及制裝費由軍統(tǒng)負擔外，所有在美國受訓時費用由美方供給，每人一萬美元。

在第二次合同中，規(guī)定美方供應的武器、交通工具等在數(shù)量上均有增加。僅十輪卡車便增加到2000輛和全部維修設備，中小吉普增到120多輛，其他醫(yī)藥、電訊制造器材等也有所增加。而抗日戰(zhàn)爭結束后，“好心腸”的山姆大叔仍怕特務部隊屠殺中國人民的武器不夠用，又從沖繩等地送來3000噸各式武器給軍統(tǒng)，并海運至秦皇島。后來因戴笠死去，內(nèi)部爭權奪利，對這件事未即處理。蔣介石知道后，便全部撥交前往東北的新六軍軍長廖耀湘接收了。這批武器雖未送到軍統(tǒng)手中，卻同樣達到了以中國人用美國武器殺中國人的目的。美帝這一陰謀，實現(xiàn)得可謂是天衣無縫，梅樂斯也因此在幾年間由一個中校連續(xù)被提升到了準將。

美帝對梅樂斯與戴笠的合作越來越重視，除了美國總統(tǒng)代表赫爾利到中美所視察過外，美帝第七艦隊司令柯克上將也前往視察，對該所工作極為滿意。戴笠更興高采烈，特意隆重設宴招待這位海軍上將，國民黨一些高級將領如程潛、張治中以及周至柔等都被邀作陪。由于梅爾斯在中國取得很大成績，美帝的其他特務機關便非常眼紅。杜諾萬到重慶時，曾與梅樂斯商談要他把一些有關情報分別供應給陸軍方面和在華美軍高級將領。但是梅樂斯不同意，結果被杜諾萬把他扣留在美駐華大使館一天多，才放他出來。由于梅樂斯一向氣量狹小，受了這一打擊，竟弄得神經(jīng)失常，1945年春回美國醫(yī)治了幾個月，直到“二戰(zhàn)”快勝利時才病愈返回重慶。戴笠去世后，他也送去了挽聯(lián)和花圈，并親自到場表示哀悼。

如果說戴笠和梅樂斯的感情還是出于私人情誼，那么他對美國太平洋第七艦隊司令柯克的關系則更多的是借以利用。1946年初，戴笠還邀請柯克到北平一游，這是戴笠與柯克的最后一次見面。當時柯克即將退休歸國，以美國海軍耆宿的地位，仍然不失為海軍界的紅人。