另外戴笠還要軍統(tǒng)局堅決貫徹他提出的“裁弱留強，里外三百”意圖的同時，在內(nèi)部體制上減少指揮層次，下令撤消所有區(qū)一級的組織，恢復在省范圍內(nèi)以省站為最高指揮機關(guān)。原來歸屬區(qū)一級指揮的特務(wù)人員，在絕對保密的情況下全部轉(zhuǎn)入地下，不再以公開機關(guān)和任何名義作掩護。在此基礎(chǔ)上，戴笠迅速清理整頓軍統(tǒng)內(nèi)部的貪污受賄問題，以免被蔣介石和政敵抓住口實。他指示毛人鳳成立一個財產(chǎn)清理委員會，自己也迅速到各地去清理財產(chǎn)。

蔣介石收到這份計劃的時候，心中還有一些疑問。因為他不相信戴笠會這么干脆地做出對他力量如此不利的削減。所以他表面上對戴笠的決定表示肯定，但是私底下卻派人繼續(xù)調(diào)查。這一查卻發(fā)現(xiàn)了諸多的疑點。

首先戴笠雖然削減了軍統(tǒng)局內(nèi)部的軍事部門，卻掌握了軍令部第二廳，把軍事情報、軍事稽查業(yè)務(wù)以及軍隊中各級諜報參謀方面的力量都撥歸進去，全部抓到手中，成立軍事特工方面的獨立系統(tǒng)。

其次戴笠掌握了內(nèi)政部警政司，并將警政司擴編為內(nèi)政部的警察總署，把軍統(tǒng)局原先主管的特工警察力量劃撥過去，形成警察行政業(yè)務(wù)與警察特工業(yè)務(wù)一把抓。

戴笠另外改編了忠義救國軍和軍統(tǒng)局的特務(wù)團，再加上軍委會的別動軍、交通警備司令部所屬的各團、交通巡警總隊和軍統(tǒng)局掌握的部分國民黨稅警部隊，把約10萬人組建成了交通警察總局。

盡管戴笠削減了各內(nèi)外勤機構(gòu)，但是他并沒有解散削減下來的人員，而是把這些人安插到各個司法行政部門，形成軍統(tǒng)化整為零后的基本力量。同時也成立了一個調(diào)查室，安頓下軍統(tǒng)局主腦部分的主腦部分。

最讓蔣介石氣憤的是戴笠竟然默許軍統(tǒng)內(nèi)部成立一個叫“警壇社”的秘密組織。而該組織成立的目的甚至是明確地表示要爭奪全國的警察大權(quán)。經(jīng)過這幾步計劃，軍統(tǒng)力量沒有被削弱，反而比原來還要更加強大。

這個消息傳到了蔣介石耳中，他沉默了很久，最后憤憤不平地說：“這個戴科長鬧昏頭了，他得明白他自己的位置?！?/p>