9月5日，起義軍先頭部隊到達長汀，數(shù)百名傷員被送進傅連暲主持的福音醫(yī)院治療。福音醫(yī)院本來是外國人辦的，五卅運動后，外國院長跑了，醫(yī)生和職工們便推舉傅連暲當(dāng)了院長。當(dāng)時傅連暲雖然不是共產(chǎn)黨員，但他關(guān)心、同情北伐革命。起義軍到汀州來，他和城里的醫(yī)生以福音醫(yī)院為中心，利用極其有限的治療手段，為部隊的傷病號治療。大部分傷員和病號經(jīng)過治療都重返部隊。后來成為人民解放軍著名將領(lǐng)的陳賡和革命老人徐特立，都是經(jīng)傅連暲的治療才得以康復(fù)的。傅連暲后來參加了紅軍，成為紅軍中著名的醫(yī)生。

在長汀，前敵委員會對攻取東江的計劃又進行一次詳細的討論。當(dāng)時有兩種意見。周恩來和葉挺主張：“以主力軍由三河壩經(jīng)松口取梅縣，再經(jīng)興寧五華取惠州，以小部分軍力（至多兩團）趨潮汕?！边@樣做有兩個好處：（1）潮汕敵軍兵力空虛，地勢又無險可守，預(yù)計可不戰(zhàn)而得；（2）如果先以主力取潮汕，再折回來取興寧、五華，攻惠州，就過于迂緩，使敵人有集中兵力、搶占有利地勢以攻擊我軍的可能。

另一種意見，主張“以主力取潮汕，留一部分兵力于三河監(jiān)視梅縣之?dāng)?，再?jīng)揭陽出興寧、五華取惠州”。他們主要是擔(dān)心敵人死守潮汕，不能很快攻下，就難以取得國際的接濟，且梅縣、興寧、五華一帶都是山路，部隊不便行動，給養(yǎng)也會發(fā)生困難。而走三河壩到潮汕，可以順韓江而下，水陸并進。由于蘇聯(lián)顧問等堅持這個主張，而一般軍官在長期行軍后渴望得到一個地方休息，也贊成這種主張。后來，就按多數(shù)意見作出決定，采納了后一方案。此次行軍路線選擇，對以后起義軍的迅速失敗有著直接的影響。