其實(shí)早在武昌起義后不久，人們已經(jīng)在談孫中山必是革命的領(lǐng)袖了。孫中山回國(guó)之后，更是受到許多團(tuán)體的擁護(hù)，他們紛紛致電南京各省代表：“請(qǐng)舉孫中山先生為總統(tǒng)，以救國(guó)民，兆眾一致，全體歡迎?！敝猩降幕貒?guó)也使同盟會(huì)內(nèi)部達(dá)成一致，即選舉孫中山為即將誕生的中華民國(guó)的臨時(shí)大總統(tǒng)。同盟會(huì)在孫中山出任總統(tǒng)方面達(dá)成一致，但卻在政體方式的選擇上發(fā)生了論爭(zhēng)。宋教仁主張采用法國(guó)的內(nèi)閣制，孫中山主張美國(guó)的總統(tǒng)制。表面上看，這場(chǎng)爭(zhēng)執(zhí)只是政權(quán)形式之爭(zhēng)，實(shí)際上是總統(tǒng)是否具有實(shí)權(quán)的問(wèn)題。孫中山力排眾議，說(shuō)內(nèi)閣制非目前所宜，我也不能做形同虛設(shè)的總統(tǒng)，以誤革命大計(jì)。12月27日，在南京召開(kāi)的各省代表會(huì)上，宋教仁依然提出內(nèi)閣制，黃興征詢(xún)大家的意見(jiàn)，多數(shù)贊成總統(tǒng)制。12月29日，在南京的各省代表，開(kāi)正式選舉臨時(shí)大總統(tǒng)會(huì)，開(kāi)票結(jié)果，孫文得十六票，黃興一票，孫中山當(dāng)選為臨時(shí)大總統(tǒng)。

1912年1月1日孫中山宣誓就職，他在就職誓詞中說(shuō)：“顛覆清朝專(zhuān)制政府，鞏固中華民國(guó)，圖謀民生幸福，此國(guó)民之公意，文實(shí)遵之，以忠于國(guó)，為眾服務(wù)。至專(zhuān)制政府既倒，國(guó)內(nèi)無(wú)變亂，民國(guó)卓立于世界，為列邦公認(rèn)，斯時(shí)文當(dāng)解臨時(shí)大總統(tǒng)之職?！彼€發(fā)布《臨時(shí)大總統(tǒng)宣言書(shū)》，提出中華民國(guó)臨時(shí)政府的任務(wù)是：“盡掃專(zhuān)制之流毒，確定共和，以達(dá)革命之宗旨。”規(guī)定對(duì)內(nèi)方針是，實(shí)現(xiàn)民族統(tǒng)一、領(lǐng)土統(tǒng)一、軍政統(tǒng)一、內(nèi)治統(tǒng)一和財(cái)政統(tǒng)一，并定國(guó)號(hào)為“中華民國(guó)”，同時(shí)決定改用陽(yáng)歷。

隨著孫中山宣誓就任南京臨時(shí)政府臨時(shí)大總統(tǒng)，依據(jù)《中華民國(guó)南京臨時(shí)政府組織大綱》南京臨時(shí)中央政府開(kāi)始組建。1月3日代表大會(huì)通過(guò)了孫中山、黃興提名的各部總次長(zhǎng)名單（見(jiàn)下表），以五色旗為中華民國(guó)國(guó)旗。從臨時(shí)政府的各部總長(zhǎng)名單來(lái)看，同盟會(huì)會(huì)員為總長(zhǎng)的只有三個(gè)部，即陸軍部、外交部、教育部，但在次長(zhǎng)名單中，除次長(zhǎng)湯薌銘外，其余都是同盟會(huì)的重要骨干。而實(shí)際上，以立憲派和舊官僚出身的總長(zhǎng)，大都沒(méi)有應(yīng)職，他們的職權(quán)由次長(zhǎng)代理，因而南京政府被時(shí)人稱(chēng)為“次長(zhǎng)內(nèi)閣”。此外，臨時(shí)政府秘書(shū)長(zhǎng)胡漢民，法制局局長(zhǎng)宋教仁等都是同盟會(huì)的重要干部。1月28日，南京臨時(shí)參議院宣告成立，同盟會(huì)議員居絕大多數(shù)。由此可見(jiàn)，以孫中山為首的中國(guó)同盟會(huì)，控制了中華民國(guó)臨時(shí)政府。南京臨時(shí)政府，完全是按照美國(guó)模式建立起來(lái)的共和民主政府，不僅是一個(gè)資產(chǎn)階級(jí)政府，而且是一個(gè)革命的政府。