為此，中央書記處召開緊急會(huì)議，決定率中央機(jī)關(guān)及一、三軍團(tuán)立即脫離險(xiǎn)區(qū)，先行北上。可是，由鄧發(fā)率領(lǐng)的中央第二梯隊(duì)還在二十里以外的阿里，而該梯隊(duì)中還有一大批黨的高級(jí)干部，必須立即通知第二梯隊(duì)而又不能讓張國(guó)燾發(fā)現(xiàn)，以免他調(diào)動(dòng)大軍對(duì)中央采取阻撓行動(dòng)。負(fù)責(zé)這次緊急會(huì)議安全保衛(wèi)工作的時(shí)任三軍團(tuán)保衛(wèi)局執(zhí)行部長(zhǎng)楊奇清被毛澤東、周恩來(lái)、彭德懷、楊尚昆叫了過(guò)去，并由彭德懷簡(jiǎn)明扼要地告訴他要把中央的緊急命令盡快送到第二梯隊(duì)。楊奇清應(yīng)聲請(qǐng)戰(zhàn)：“我親自送！”毛澤東搖了搖頭：“你目標(biāo)太大。”周恩來(lái)與彭德懷也表示了同樣的意見：不到萬(wàn)不得已，楊奇清不要出馬，因?yàn)閺垏?guó)燾知道楊奇清的重要性，還因?yàn)閺垏?guó)燾已經(jīng)派出不少密探在暗中監(jiān)視黨中央——如果楊奇清在這非常時(shí)刻離開黨中央駐地前往第二梯隊(duì)，就必然會(huì)被密探們發(fā)覺(jué)而報(bào)告張國(guó)燾，引起懷疑。

楊奇清立刻找到政治可靠、辦事干練的保衛(wèi)局執(zhí)行部預(yù)審員葉運(yùn)高，讓他來(lái)?yè)?dān)當(dāng)此次緊急送信的特殊任務(wù)：“你跑步前進(jìn)，不得有誤。8點(diǎn)出發(fā)，9點(diǎn)以前務(wù)必將命令親自交給鄧發(fā)同志。第二梯隊(duì)在凌晨3點(diǎn)前必須全部趕到阿西。已經(jīng)給你選好了一個(gè)手槍班，在路上如果遇到攔阻、人數(shù)不多就干掉；如果對(duì)方人多，就設(shè)法突圍；萬(wàn)一你被他們抓住，一定要把信毀掉。”

很快，中央密令送到了第二梯隊(duì)。第二梯隊(duì)及時(shí)轉(zhuǎn)移，與中央機(jī)關(guān)和一、三軍團(tuán)迅速撤離了危險(xiǎn)區(qū)。等到張國(guó)燾收到密探們傳來(lái)的情報(bào)時(shí)，中央紅軍已遠(yuǎn)在幾十里之外，他已經(jīng)鞭長(zhǎng)莫及了。

1935年10月，中國(guó)工農(nóng)紅軍第一方面軍到達(dá)陜北。中央決定將徐海東部與劉志丹部合并組成紅十五軍團(tuán)，調(diào)楊奇清擔(dān)任十五軍團(tuán)保衛(wèi)局局長(zhǎng)。次年6月，紅十五軍團(tuán)與紅一軍團(tuán)合并組成西征軍向隴東進(jìn)發(fā)，鞏固和擴(kuò)大陜甘根據(jù)地并接應(yīng)二、四方面軍出草地。隨后，紅十五軍團(tuán)又為了打擊國(guó)民黨頑固派馬步芳的反動(dòng)勢(shì)力，開辟陜甘寧邊區(qū)，進(jìn)行西征。楊奇清負(fù)責(zé)西征軍的情報(bào)工作。他部署軍團(tuán)保衛(wèi)局的干部們通過(guò)廣泛地做沿途百姓的工作，建立起情報(bào)工作，詳細(xì)了解敵人各方面的情況，使十五軍團(tuán)的行動(dòng)決策能做到“知己知彼，百戰(zhàn)不殆”。

1936年12月西安事變后，紅軍主力進(jìn)駐陜西三原、耀縣一帶，楊奇清任中國(guó)工農(nóng)紅軍前敵司令部保衛(wèi)部部長(zhǎng)。為了適應(yīng)革命形勢(shì)發(fā)展的需要，他在三原云陽(yáng)鎮(zhèn)舉辦了較大規(guī)模的保衛(wèi)干部訓(xùn)練隊(duì)，既輪訓(xùn)在職的保衛(wèi)干部，也吸收一些優(yōu)秀的知識(shí)青年黨員，對(duì)于提高保衛(wèi)干部的素質(zhì)、擴(kuò)大保衛(wèi)干部的隊(duì)伍起了重要作用。楊奇清不但要處理訓(xùn)練隊(duì)的各項(xiàng)事務(wù)，而且還親自給學(xué)員講課。這個(gè)訓(xùn)練隊(duì)的絕大部分學(xué)員，后來(lái)都成了保衛(wèi)戰(zhàn)線的骨干。