陸榮廷把主要精力放在協(xié)同廣東代都督陳炯明一起平定原廣西會黨首領、同盟會員，宣稱要打回廣西奪都督之位的王和順等人非法組織的“扶正同盟會”在廣西的活動。所謂的“扶正同盟會”為達到推翻現(xiàn)有兩廣都督之目的，滑稽地擁立孫中山的胞兄孫眉為領袖，后來就連孫眉也不得不宣布：“近有不肖之徒，私立扶正同盟會，冒用鄙人名字，煽惑愚民，妄希第二次革命，似此不法行為，鄙人并未與聞，亦斷不承。”

當時民軍成分復雜，組織渙散，紀律廢弛，有的與匪無異，因此各省民軍相繼被下令解散。王和順等人組織令人啼笑皆非的“扶正同盟會”無非是為了奪權，其統(tǒng)率的民軍最后被廣東都督陳炯明派兵包圍繳械，至此王和順欲回廣西奪都督之位的企圖徹底失敗。

既得到孫中山明示并承認，此前穩(wěn)定全省秩序的舉措并無不當，陸榮廷把“唯亂是仇”當成準繩，無論是誰，無論何黨何派，破壞穩(wěn)定，有血債者必懲。這一手令人信服，所巡之處無不平定。此前，曾被陸委為軍政府交通部員，后任懷集縣知事的同盟會員羅佩珩，卻乘著調任懷集縣知事之際，不待請示擅自處死縣議會副議長等4人?？h議會是全縣的民意機構，無論出于何種動機，縣議會副議長都不能不經(jīng)請示擅殺。此事如不處理，如果誰自居有功，都行擅殺，全省還不大亂？盡管羅佩珩是同盟會員，但陸榮廷也只能鐵面無私，將其押解到南寧槍決。民軍首領周紹梅在藤縣起事，被省軍所俘，陸榮廷下令寬大釋放。但周事后仍糾集黨眾襲擊縣城，開放囚犯，糾眾千余人作亂，被龍覲光帶兵平定。周本人逃到廣東佛山被俘，解回梧州槍決。

對于在百姓中有威望的會黨首領，只要真心擁護廣西新政權，陸榮廷也不惜羅致，甚至委以重任。如對民軍首領李立廷的任用就非常成功。李立廷為“三點會”大頭目，是1898年玉林五屬起義的首領。當年他率義軍十余萬圍攻玉林州城，玉林城周圍百數(shù)十里的村莊，到處高豎紅旗，大書“替天行道”、“反清復明”和“吊民伐罪”等標語；人人臂纏紅布，途中相遇，互稱“契弟”，統(tǒng)稱李立廷為“大哥”。由于玉林州城久攻不下，義軍被清軍鎮(zhèn)壓，李立廷只身逃出海外。辛亥革命后，李立廷回到廣州，與王和順、黃明堂等廣西籍會黨首領領導民軍。由于歷史的原因，李立廷對桂南一帶具有很大的號召力。1912年1月，陸榮廷誠邀李立廷返回梧州，委其為廣西省水師第二軍統(tǒng)領，令其駐防藤縣蒙江圩，管轄貴縣至梧州沿河治安。后，李立廷歷任都督府軍事顧問、梧州水上警察廳廳長等職，盡忠職守，當時在柳、郁、潯、桂四江來往的船只，再也不受沿河土匪騷擾。