智顗一行到了南京，兩年后，被朝廷迎請進瓦官寺。瓦官寺是東晉元帝造的，規(guī)模相當宏大。

智顗在這里住了八年。

按道理講，師徒兩人在一個城市，應該是有會面的，但史料沒有記載。只說智顗有了位弟子，叫灌頂，后來成為大師，對天臺宗的發(fā)展起來了重要作用。智顗的著作大部分都是灌頂記錄成書的。灌頂也是國清寺第一任住持，后被尊為天臺宗的五祖。

陳宣帝也信佛。上行下效，朝廷權貴，都對智顗表示十分的敬重。光祿王固、侍中孔煥、尚書毛喜等，曾奉敕“一日停朝事”而畢集于瓦官寺，聽智顗宣說佛法。特別是仆射徐陵，據(jù)說在夢中奉先祖之命要對智顗“一心事之”，因而對智顗“資敬盡節(jié)，參不失時序，拜不避泥水，若蒙書疏，則洗手燒香，冠帶三禮，屏氣開封，對文伏讀，句句稱諾”，幾乎是將智顗當皇帝一樣對待了。

智顗在慧思門下受學多年，在禪觀方面頗有造詣。但初到建康時，人們并不認可他。

有一老僧法濟，在禪學方面很有名氣。智顗去見他，法濟躺在那里不起身，問智顗道：有人正在入定，聽見金陵北方六七里處的攝山有地動的聲響，知道山中有人練無常觀。這是什么禪定？

智顗說，定充其量只是邊定，并沒有真正深入禪定。要知道，凡是得到一點定境，就要向人夸耀，定功就會散失。

法濟一聽，趕緊起座禮拜，說自己曾經(jīng)得到這種定，但是一向人說出，不知怎么，定功就散失了，如今才知道原來如此。